在不同的研究领域或针对不同的研究问题，个案研究实施的具体程序有所不同。在临床心理学领域中，个案研究首先要识别与确定研究对象；然后是通过各种方法或渠道收集已确定的研究对象的有关资料；再依据收集到的有关资料，进行资料的整合，并做出合乎逻辑的诊断；然后是实施矫治或调整；最后是跟踪研究或随访。[14]
罗伯特·K.殷从人类学、社会学的角度提出个案研究的实施程序：确定问题、设计方案、收集数据、分析数据以及撰写个案研究报告。另外一些学者立足于教育研究视角，提出个案研究法的程序，首先要确定个案，对个案的现状进行评定，收集个案资料，整理分析资料，对个案进行补救、矫正与发展指导，再进行追踪研究，最后是撰写研究报告或论文。
在众多关于个案研究实践步骤的讨论中，约翰·罗森堡（）和帕齐米·耶茨（）的讨论是相对比较详尽完整的。他们认为，个案研究的实施过程包括研究问题的提出、研究主题和理论基础的确定、研究个案的确定、研究方法的选择、收集数据方法的确定、数据分析方法的确定、通过预先设定的分析过滤器对已分析的数据进行完善、使用矩阵将数据简化为可管理的模块和概念组、得出结论并撰写个案报告。同时，他们还提出可以通过图表的形式将整个研究过程进行呈现。[15]下面将结合本章案例“武汉市江岸区辅读学校课外活动实施的个案研究：以轮滑活动为例”对约翰·罗森堡和帕齐米·耶茨关于个案研究的实施步骤展开具体的介绍。
一、个案研究的基本步骤
（一）研究问题的确定和提出
开始个案研究，首先要确定研究问题。教育研究的问题大多数来自于教育实践，是在教育实践中产生并有待解决的问题。可以从以下三个方面对问题的性质加以考虑。第一，价值性原则，即研究问题是否在理论和教育实践上有价值。第二，科学性原则，即研究问题是否以一定的科学理论为依据。第三，可行性原则，即研究是否具备客观条件、主观条件等。个案研究比较适合研究那些需要探求原因、改善模式的问题。如陈向明在“关于我国中部农村儿童辍学问题的个案研究”中指出，已有的研究中“定量的方法不能在微观层面上进行细致的描述和分析”“没用再现辍学学生和心理状态和意义建构方式”“没有对辍学的具体情节和过程进行探讨”。
其次，研究问题的内容应该以研究课题也就是研究题目的形式具体明确地反映出来。研究题目应该简单具体地展示个案研究的对象、研究问题、研究方法。如“武汉市江岸区辅读学校课外活动实施状况的个案研究：以轮滑活动为例”“对小学高年级偏科学生自信心培养的个案研究”“农村小学素质教育的现状及其影响因素的个案研究”。
（二）研究主题和理论基础的确定
虽然并不是所有的个案研究都是在数据收集之前进行文献回顾的，但是对研究背景的理解的确是个案研究的关键步骤。基本主题和理论的确定是研究的一个重要组成部分。如“功能视角下的普通话儿童3岁前语言发展个案研究”，其理论基础为“功能”理论，研究主题为“语言发展”[16]。再如“创建学习型组织背景下的成人学习和成人个性发展研究”，确立其理论基础为“创建学习型组织”，主题包括“成人学习”和“个性发展”[17]。
（三）个案的确定
个案及其背景以及感兴趣现象的确定可能是个案研究中最重要的一步。因为如果没有明确的界限限定个案，个案研究会变成一堆无法处理的数据[18]。这一步对第一步中所提出的研究问题进行分析和解读，是对第一步的进一步深化。通过这一步骤，研究者更加明确个案及其背景以及感兴趣的现象。
（四）具体研究方法的选择和数据收集
