除了《六首无伴奏小提琴奏鸣曲和组曲》，巴赫在柯登时期还创作了三首著名的小提琴协奏曲。此前，巴赫一直演奏或改编其他音乐家的作品，直到自己创作能力逐渐成熟后，才开始着手小提琴协奏曲的创作，这时的协奏曲为三个乐章形式，采用慢、快、慢的结构布局。
《A小调小提琴协奏曲》（BWV1041）创作于1720年，是巴赫的第一首小提琴协奏曲，据记载，这首作品是他为自己所写。此时的他，正遭受着家人死亡的哀痛，所以音乐中思绪万千。第一乐章由全奏拉开序幕，活跃而有力的旋律后，引出小提琴柔美哀伤的音乐动机，这个动机具有典型的巴洛克风格。在第五小节至第七小节中，是一个连续十六分音符的乐句，在一拍四音中，小提琴采用一加三的弓法，即一弓一音紧接一弓连奏三音的演奏方法。四个音不均衡的音响造成的冲突感，具有较强的动力性，也很有特点。这种弓法在巴赫的作品中常被使用，并一直被沿用至今。随后，乐队做出应答，相互交替，在全奏和独奏相互竞争又相互衬托的气氛中，音乐的主题被表现得淋漓尽致。第二乐章的慢板充满了巴赫式的深度和哲理性，起伏的旋律象征着苦难与光明的交替，就像是巴赫面对困境展现出超脱现世的乐观的心态。经过深重困境的洗礼，巴赫赋予第三乐章活泼轻松的旋律，三拍子的舞曲形式使人在音乐中欢快的滑行，赋格曲形式的安排暗藏着巴赫精湛的复调写作技巧。
《E大调小提琴协奏曲》（BWV1042）则是巴赫小提琴协奏曲中最受演奏家欢迎的作品。第一乐章的主题，在主和弦的分解音程上分别奏出了三个强有力的四分音符，音乐显得干练质朴，随后，独奏部分的十六分音符在同一个音上展开，并做模进音型进行，音乐酣畅淋漓，极具美感又富有内在的张力，独奏与协奏相互交流，并不断在同一主题旋律上做变化开展；第二乐章是以固定低音为基础，写成的一首伤感而又温暖的乐曲，其中的复调音乐创作手法耐人寻味。最后乐章则是一首回旋曲，回旋的主题由弦乐组演奏，而独奏穿插其中演奏不同的旋律，好比是华彩部分，此刻，音乐的美感与演奏技术的结合相得益彰。
《D小调双小提琴协奏曲》（BWV1043）是巴赫为柯登宫廷的18人乐队所作，除了两个独奏小提琴之外，乐队由第一小提琴、第二小提琴、中提琴和数字低音声部乐队组成。现在演奏这部作品还会加上大提琴、低音提琴和钢琴以增加演奏效果。整部作品的重点都在于表现双小提琴之间默契的配合，因此，乐队只起到一种伴奏衬托的作用。第一乐章由活泼的快板作为开始，基本主题由第二小提琴奏出，第一小提琴把旋律移高五度模仿，并通过赋格的方式竞奏，互相之间交谈、嬉戏，营造出一种欢乐的气氛；第二乐章的广板，同样采取这种演奏方式，基本主题还是由第二小提琴奏出，而后第一小提琴五度模仿，但整个乐章小提琴的音色较为柔和，突出歌唱性特点，整体风格转为幽静、庄重，与第一乐章形成鲜明对比；第三乐章的快板具有舞曲风格，全曲气氛热情而活泼，独奏和协奏交替出现，旋律连绵起伏，把作品推向**，并在**中结束。
这三部协奏曲均以三乐章为结构，形成快—慢—快的音乐进行节奏，和谐而充满动力，复调技巧被巧妙地安排进去，既不繁杂也不空洞，足以看出巴赫丰富的想象力及其高深对位技巧。
