他的最后几首弦乐四重奏（op.71，op.74，op.76，op.77，op.103）作于1793-1803年间，除了最后一首op.103未完成，一共4套14首，是他四重奏创作中最完美的杰作。这些作品意气风发、气势不凡，慢乐章的变奏别致典雅，结构形式的展开、素材的发展和情感的表达在这里达到了无与伦比的和谐统一。
Op.76的6首四重奏，无论是上演次数还是灌制唱片的数量都远远高于海顿其他弦乐四重奏作品，而当时这部作品题献与埃尔杜迪（JosephErd?dy）伯爵时只换来了区区100银币。如果海顿尚在世，任何一个小厂牌唱片公司就这部作品支付他的版税收益也将远远高于那笔钱。不过相对于莫扎特来说，海顿的生活已经极其优厚了，除了乐谱版税，两次英伦之旅也给他带来了可观的财富。
※海顿在演奏弦乐四重奏
Op.76第一首G大调四重奏，3个有力的和弦之后，主题从大提琴声部开始，自下而上作赋格式陈述，但其实这里不是真正严格的赋格，听觉中并没有强烈的复调特征，而且立即就变成了真正的和声织体，这种手法在海顿作品中经常出现。柔板乐章深沉、内敛，有着缓缓流淌的深情。小步舞曲乐章的凌厉弓弦、节奏锐势和突强的震音倒是更接近贝多芬式的谐谑曲。三声中部，拨弦的背景下，建立在分解和弦基础上的第一主题极其优美，第二主题又仿佛是第一主题的镜像（倒影），同样恬美优雅。第四乐章以同主音小调开始，只是在再现部才“返回”原调（G大调），是的，海顿的一生都在不断探索和实验。
※弗朗茨二世皇帝即所谓『神圣罗马帝国』的末代皇帝，在拿破仑崛起后，神圣罗马帝国解体，1804年奥地利帝国建立
Op.76第二首D小调四重奏，因旋律一开始以下行五度开始，故得名“五度四重奏”。第二乐章，在拨奏下，第一小提琴的主题旋律悠然踱出、静谧而游哉，发展部的变奏更为优美。第三乐章小步舞曲部分是以“无终卡农”的形式写成，这是一种被以对位手法设计而成的，可以“尾一首”衔接不断反复演奏下去的模仿风格的复调结构，以今天的视角看，可以称之为“Loops复调曲”了，这不但显示出海顿深厚的对位技术功底，其旋律也同样精妙而富于动力。三声中部绽放出鲜明的舞蹈性，渐强的和弦音似乎是跳舞前的“踮脚”预备动作，第一小提琴上奏出逐渐上升，越来越纤细的欢快主题。第四乐章以D小调开始，最后结束在同主音大调上。
※弗朗茨二世皇帝的另一幅肖像
Op.76中最著名的当属第三首，因其第二乐章采用《皇帝颂》的旋律，而得名“皇帝”弦乐四重奏。1797年2月12日，海顿为皇帝弗朗茨二世[2]的生日奉上一曲颂歌《上帝保佑吾皇弗朗茨》（GotterhalteFranzdenKaiser，又名《皇帝颂》），随后此曲先后成为神圣罗马帝国、奥地利帝国和奥匈帝国国歌（唱词不同），后被填词成为《德意志之歌》（DasDeutschlandlied），1922年成为德国国歌[3]，1990年，统一后的德国仍然沿用。这首曲子的复杂经历也见证着奥地利的命运和版图的变化。当拿破仑的炮声在维也纳城外隆隆作响时，维也纳民众自发地组织起来，此时的“海顿爸爸”身体已非常虚弱，坐在坐椅中，被游行的队伍抬着，随着人流缓缓地在城内绕行。情绪高涨的民众一遍遍地唱着海顿的那首《皇帝颂》，据说贝多芬也在人流中。
※《弗兰茨会见拿破仑·波拿巴》，一系列失败的战事之后，弗朗茨皇帝被迫接受了令奥地利沮丧的条约
