一处大雪山上，一名新的女孩被斯卡带来，张族由于王平的庇护。所以相对安全，但是清国有50族。
于是较弱的林族林美，替代了张梅来到了亚美利多斯，并且戏剧性的与斯卡相遇，并教授阿尔冯斯等人炼丹术，而藉由炼丹术，众人发现其阴谋，并由斯卡哥哥的笔记，找出破解的法阵。
而这时候新生的恩维，在接收前任的部分记忆后，准备追杀阿尔冯斯，这时候阿尔冯斯几人开始将计就计，与恩维展开了激战，在恩维变出真身。
对着阿尔冯斯几人攻击时，趁机抓住了马尔科博士，却被马尔科博士以破坏贤者之石的方式，将他彻底打败，露出了渺小的真身，在斯卡鼓励下，林美带着恩维返回，却被当地居民热情招待，触动心理的感触。于是决定前往中央市，也正好中了恩维的计。
另一方面，爱德华与金普利发生激战。因为自己的仁慈，给金普利偷袭的机会。
于是激战之处发生坍塌，爱德华被钢筋刺穿。但还是拚着自己重伤，救出金普利部下。于是在金普利部下的帮助下，离开激战处，开始潜伏疗伤。
而在雪山激战的阿尔冯斯等人，开始分道扬镳，决心阻止所谓的父亲，阿尔冯斯前往雷奥尔，遇到之前被宗教欺骗的罗赛，罗赛这时候已经完全脱离了以前的阴暗，并且还遇到了霍恩海姆，并且阿尔冯斯从父亲口中得一切真相，另一方面温莉在偷偷回家时，遇到了正在躲藏的爱德华，双方差点擦枪走火。
但是也更加坚定双方的感情，也在这个时候，中央市的车站下来了一个老头，司马传次郎王平的老人马甲再现了。
“这里还是真是一样热闹，不过那地下室的家伙，大概快抓狂了吧，毕竟我可是换了马甲。”想着想着王平开始得意的笑了，他又被通缉。
于是只好换个马甲潜入中央市，他又开始了老一套，准备在这里待机，给老家伙致命一击。
而这时候爱德华遇到姚麟也就是古利德，并且为了拉拢古利德，干愿担任其部下，这一点让古利德受到莫名感动，另一方面阿尔冯斯也开始潜入，东方与北方也开始准备实战演练，其实是双方企图叛变中央，斯卡这时后也与伊修瓦尔人会合，决定开始对父亲展开攻击，而一座地下室中，王平正在耐心保养他的武士刀，拉斯是双刀流。因此王平也准备两把刀，王平开始耐心等待约定之日到来。
而这时候阿姆斯壮少将来到家中，表示自己要继承家业，请父亲出国隐居。
于是与阿姆斯壮少校发生争执，姊弟展开对决，不到几分钟，阿姆斯壮少校被彻底蹂躏。
但是他也确定自己姊姊与自己是同一边，而另一方面东方的拉古曼用计企图炸死拉斯，不过并未成功，拉斯还是偷偷回到中央了，双方开始备战了。
“真是厉害呀，真理的印记，我竟然用了数百灵魂的存在之力，才将这印记封印。换句话说，夏娜世界的那些红世之徒，也许真的很可怕，不过也对，蒂丽亚跟黑暗雨滴都是属于出现一集的配角而已，都是高级魔奴了，有时间也许可回去那个世界，自在式真是厉害呀。”王平手中一个自在式，将全身完全包围，他要参战的问题还有一个，那就是遍布首都的炼成阵，由金牙操纵非常难搞的存在，会一瞬间让他这个看过门的存在被搞到小人那里，所幸他与真理之门的交流不少，那个炼成阵是以真理留在身上的印记为标的。
而在其他能力无法使用的时候，王平再度自省自己的能力，终于发现一个不输给这世界炼金术的能力了，同样是吃人的自在式。
在王平准备一切的时候，爱德华兄弟与普莱德开始交战，普莱德的能力。
对于精通阴影的王平非常清楚，但是对于爱德华兄弟，却是一个强敌，爱德华费尽一切力量，甚至阿尔牺牲自己，才将普莱德彻底封印在土墙内。
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