熊文灿最担心的，是军中“畏髡如虎”。他自到肇庆接印便有这样的感觉，尤其是从琼州逃归和赎回的残兵败将们，都听不得“髡贼”二字。若说个“打”字，个个都是摇头。说起髡贼，不外乎老生常谈的“船坚炮利”、“悍不畏死”、“器械精良”……这些，熊文灿自上任以来耳朵里都快听出茧子来了。
一开始他以为这不过是败军之将讳败的借口――自古皆然。然而久而久之，特别是常青云到他幕中之后，他才知道所言不虚。特别是髡贼奇袭中左所，一举击溃了朝廷多年来奈何不得，水陆军容东南最盛的郑芝龙集团，不但将中左所夷为平地，还阵斩了郑芝龙。熊文灿这才对澳洲人的实力有了一个清楚的认识。
所以他从未真正考虑过如何在军事上对抗髡贼，更多是考虑“招抚”。
熊文灿以招抚郑芝龙发迹，又因为招抚张献忠而毁身。招抚一直是对待各路反贼的“灵丹妙药”。因而他重整广东明军之后不久，便开始着手招抚髡贼。
然而几个月前，常清云与潜入肇庆当地的真髡谈判招抚，却被对方一口回绝
不仅如此，对方还很明确的提醒他，元老院即将兵进广州，如果他想保住自己的官位性命，还是早早的某调职远去。
熊文灿自然不会因为髡贼的一句话就远遁而去。他知道澳洲人绝非虚言恐吓之辈，然而按照官军打仗的速度，如果要他调集两广大军会剿琼州，起码也得用八个月到一年的时间来筹备；换成髡贼要从海南出征，靠几千精兵断然是不成的，少不得在琼州“扫地为兵”，裹挟百姓，再加编练成军，绝不会少于半年。
因而他多少做了些准备：在佛山铸造了不少大炮；新造了许多火器――有许多都是按照兵书和各地文人、将领们进献给朝廷的图册新造的；扩充了各地营兵的员额。又在疍户中额外雇勇五千人补充珠江口内外各处的水师。
包括肇庆本身的安危他也没忘记：第一批用上新式磨盘炮座的红夷大炮便是装在羚羊峡峡口的。不仅在东口设了炮台，还按当年在虎门吃了败仗的一个将领的建议，在炮台旁常驻一哨人马守卫。
羚羊峡不但东口有炮台，在靠近肇庆府城的西口他也设置了炮台和一哨营兵，原来他还打算在峡谷中段夹江再设两处炮台，然而派人去看了都说工程浩大。羚羊峡两侧的山虽不是悬崖峭壁，但是要将重达几千斤的红夷大炮运上没有道路可言的山顶，再修成炮台，没有数年功夫定然难成。
为了防备髡贼可能不走水路改走旱路，他在肇庆城西北面的北岭山上新设了营寨，派驻了一哨人马驻守，控遏峡谷山路。
没想到，他们来得居然这么快！而他投入不少钱粮重建起来的珠江口的武备完全的无用：守军一路望风而降，不但虎门炮台一炮未放，连广州城也是无血开城。他辛辛苦苦重建起来的练兵游击属下的一千多人马，竟然直接投了髡。练兵游击只带了十几个亲兵家丁脱身。
熊文灿心中暗暗懊悔。自己的所谓“从容布置，节节抵抗”谋略，竟成了画饼！
此刻悔亦无用。广州既已丢失，肇庆便等了必守之地。
然而此刻已经不容他从容准备。事实证明：他对伏波军的进军速度估计同样有误。伏波军进入广州之后几乎未做任何停歇，即未“休整数天”，也没有“大掠三日”，几乎是马不停蹄穿城而过，直奔肇庆而来。从广州逃奔来的官吏缙绅的口中，他得知伏波军马不停蹄，乘船沿江而上，才不过三天功夫，伏波军便已兵临羚羊峡。
然而肇庆兵力并不多，仓猝之间也无法调罗定的东西两山参将来协防。成建制的只有肇庆水师营。连他自己和从广州等地逃来的军将官员们的亲兵家丁，本地堪用的卫所操军……全加起来也只有二千多人。另有疍家水勇一千人。
根据塘报，在羚羊峡聚集的髡军亦不过三千人上下，水师大小船只数百。其中几艘大船都有“巨炮”，显然，在江面上让水师去迎战必败无疑。于是“火攻船”这个主意便再一次的成为明军将帅的共识。
