脱离了同盟会，再次回到光复会的蔡元培去见袁世凯，袁世凯所表达的“善意”令蔡元培得到了极大支持。带着惶恐和喜悦的心情，蔡元培与北洋信使一同到了浙江。段祺瑞没有毁约，而是把六百多伤痕累累的俘虏一并释放。
自打1907年开始，陶成章等人的实际革命行动，以及蔡元培与同盟会的亲密，一度让蔡元培在光复会中被边缘化。袁世凯给的“大礼”让蔡元培声望大涨。被释放的六百同志加上在安徽养伤休整的一千多部队，以及重新收拢的逃散光复会成员一起南下，进入袁世凯给光复会划下的区域。
陶成章本来建议部队分散。蔡元培坚决反对，他要求光复会明目张胆的退据青田。段祺瑞对在南部浙江活动的光复会不理不睬。这看似完全不可靠的“和谈”居然成功了。光复会上下对疏远已久的蔡元培都生出了信赖。
光复会不仅在等待，这些历经考验的坚定骨干们全部参与到光复会未来方向的大讨论中。战肯定是战不过北洋的。经历好几次生死考验的光复会成员，特别是那些被释放不久的光复会成员充满了厌战情绪。
在陶成章的统领下，光复会经历了不少失败。不过这些骨干们并没有想把陶成章彻底否定，特别是徐锡麟和秋瑾坚定支持陶成章。会议上“反对陶成章左倾冒险主义路线”的批判虽然比较激烈，但是也没到一定要把陶成章打倒的地步。
徐锡麟联合在安徽参与农村地方工作的光复会同志，经过商讨，提出“联合人民党。共同发动人民革命”的观点。在徐锡麟看来，这个观点一度得到了不少人明确支持，以及相当一部分人的默许。至于革命工作开展地，徐锡麟认为到紧挨安徽的浙江长兴县展开工作比较合适。
这个提议立刻遭到了蔡元培的激烈反对。蔡元培表示，“既然已经与袁世凯达成了协议，那么近期不合适到浙江西北展开工作。”
“北洋根本就不会在乎那么偏远的一个山区。背后还是人民党的地盘，段祺瑞更不会自找麻烦。”徐锡麟拼命的劝说同志们。
光复会同志们好不容易得到了休整机会，大多数并不赞成与北洋再起任何冲突。而且在杭州战役中，徐锡麟并没有参加，不少人完全忘记了他们在南京把徐锡麟抛在死地这件事，反倒对徐锡麟等人没能回援杭州耿耿于怀。
一般来说，一个政治组织如果有强势领导人，例如满清的慈禧，北洋的袁世凯，人民党的陈克，在这种时候还是能够强势引导政策的。可光复会从来不是一个真正意义上的利益集团，作为一个革命家与会党们的结合体，光复会只是靠个人威望或者资历形成的团伙，从没没建立起过有效的组织体系。伴随革命进程的发展和挫折，个人威望也在起起伏伏中形成了倾向蔡元培、陶成章、徐锡麟的三派。
这种会议一旦进入僵局，就很难再打开局面。徐锡麟和陶成章秉持着一贯的豪杰兼率性读书人的狷介特点，都不愿意用自己的名望来塑造组织制度。在这种时候，两人都认为当务之急是先达成共识，团结同志。
反倒是蔡元培毫不客气的开始争夺起主导权来。作为光复会的创始人之一，蔡元培之所以后来不愿意与光复会在一起，就是讨厌这种江湖气。不管同盟会有什么问题，同盟会本身起码有一个优点，那就是能够以全中国的角度考虑问题。虽然说无法理论的说清楚此事，蔡元培就是不能接受陶成章与徐锡麟这种“小家子气”。
不过蔡元培毕竟没有领导过武装斗争，大家能接受蔡元培作为创始人的地位，可还是不能接受其全面领导。不懂军事的人统领军事的结果，这些出生入死的战士们太清楚了。
袁世凯夺取北京政权的消息一出，震动了天下。光复会守到的震动尤其大。一直困扰着光复会的最大问题，“袁世凯为什么要和光复会达成如此宽容的协议”，在光复会中立刻达成共识。准备推翻满清的袁世凯是发自内心不愿意把兵力投放在与光复会这些革命党的战争中。
