以庞统为雍州刺史，督陇西诸郡政事，并署大司马府事，以张飞都雍州军事，率军两万留镇陇西。以法正为凉州刺史，督凉州政事，参署大司马府事，以马岱率军一万都督凉州军事。迁大司府入汉中，以马超为汉中太守，调诸葛亮入汉中，署理大司马府事。以董和为益州治中从事，留署益州政事。调刘封为巴郡太守，坐镇江州。以陈到为梓橦太守，坐镇梓橦。其余方绍、黄忠等出征有功之臣，诸葛亮、蒋琬等治政之臣，李严这等平叛之臣，亦皆封侯。
刘备这一次的人事任命，可是颇费了一番心思。首先陇西与凉州乃是法正此等关陇士人的老家，故而在新得诸郡中，关陇士人任太守者占据了大半，而法正更是兼任了凉州刺史一职，这既是对关陇士人的一种奖赏，亦是一种拉拢与鼓舞。
不过，刘备又以庞统领雍州刺史，以张飞督雍州军事，而新得之地，如天水这等要害之地的太守，又以荆州士人，或是自己的信任之臣担任，这同样又是对关陇士人的一种钳制。
对于马超，刘备当然不放心让在陇西与凉州获得实权，但又怕冷了其心，故任其为汉中太守，既是一种信任，又把他放在了身边，容易控制，而且又以其弟马岱督凉州军事，反又显示了对马氏一族的信任。
又因为随着陇西等地的攻克，如果仍以地处偏僻的成都为核心，则显然不利于掌握全局，因此刘备便将大司马府迁往了汉中这个荆益雍凉的中心地带，以便更方便的控制四益州。
而正是因此，刘备不得不将诸葛亮一并调往汉中，主持大司马府事。虽然以董和署理益州政事，但刘备又不放心，故而任亲兵将领出身的陈到为梓橦太守，将汉中通往成都的条条要隘，牢牢的处于掌握之中。同时，又命刘封为巴郡太守，都督巴东、涪陵及巴西三郡军事，此三郡乃荆益二州相接之地，刘备以养子坐镇此三郡，其用意自然是不言而喻。
当然，刘备那用人的手段的确也是一流，似黄忠这等悍将，虽然作战勇猛，但刘备亦知其无坐镇一方的能力，如方绍这样的顶级谋士，虽然屡出奇谋，但理政之才却是其短肋，因此，刘备所给予这两类的有功之臣就是封侯加赏。
又因法正与庞统坐镇在外，诸葛亮又忙于政务，则方绍一跃成为了刘备身边头一号的谋士。
在一系列的人事部署之后，刘备自率九万兵马回了汉中，其余近七万的兵马留镇与陇西凉州等诸处要害。
当刘备从陇西从容的回往汉中之时，曹操已带着一腔的怒火早先赶回了许都。
曹操先是令曹仁扑灭了南阳屯田民的暴*，又令曹洪剿灭了洛阳附近几个县的叛乱，并对叛乱地区的官民进行了严厉的打击，凡参与叛乱官吏，一律诛以九族，城破之后，亦以十三岁以上者全部屠之。
而当曹操抵达许都之后，一场大规模的清洗立刻也随之展开。
先前曹操未到之前，许都的一些官吏，曾经发动兵变，企图夺取许都控制权，却因势单力薄而为夏侯憞扑灭。曹操回到许都后，一不做二不休，顺腾摸瓜，把与反叛有关联的许者两百多名汉官统统搜捕下狱，杀得杀，发配的发配。顺势将朝廷的汉官，统统的换成了自己的亲信，并将皇宫内外守卫一并更换，同时令曹休兼任皇宫警卫，彻底的将汉帝置于自己的眼目监视之下。
在严刑拷问之下，有人供出国丈伏完也参与了之前的叛乱，于是曹操当即下令将伏完一族尽皆下狱，又命尚书令华歆带兵入宫去抓捕伏皇后。
汉宫之中，一片森然。
刘协呆呆的望着殿外的天空，白云悠悠，天色蔚蓝，但他的脸上却皆是委靡之色。
这时，一只鸟雀从檐下掠过，欢叫着飞上青天，好不逍遥自在。
刘协长声长叹，喃喃低语道：“我这皇帝做得，还不如一只飞禽自在，唉，活得还有什么意思。”
刘协正在感慨之时，却见伏皇后哭泣着奔入殿内，跪伏在刘协跟前便哭诉道：“陛下，魏公将臣妾一家老幼尽皆下狱，求陛下想方设法搭救啊。”
面对伏皇后的哭诉，刘协并未太过吃惊，只是将她轻轻扶了起来，叹道：“朕听闻许昌发生叛乱之事时，就知道会有这样的结果了。皇后，朕不是不想救国丈一家，只是朕也无能为力呀。”
“陛下，陛下……”伏皇后也知道他这皇帝夫君有名无实，听其这番话语，也只好无奈投入他的怀里哭了又哭。
正悲悲切切之时，忽然沉重的脚步声传来，片刻之间，便见尚书令华歆带着数百甲兵汹汹入殿。
华歆一瞧见伏皇后，立时目露凶光，喝道：“奉魏公之命，逮捕叛党伏氏下狱，尔等还不速速动手。”
甲士兵扑上前来，将惊恐的伏皇后从刘协怀中拖了出来。那伏皇后又哭又嚎，死拉着刘协不放。甲士们到底是对皇帝有稍许敬畏之意，故见那伏皇后死拉着皇帝，便不敢太过用力。
华歆见状，几步上前，一把抓住了伏皇后的头发便狠狠拖拽，伏皇后只觉头皮欲裂，剧痛之下只得松手，甲士们趁机便将其从皇帝身边拖走。
刘协眼见皇后被带走，必是有死无生，悲怯万般之下，亦顾不得皇帝的身份，伏在华歆面前便苦求道：“华尚书，请你看在朕的薄面上，放过皇后吧，求你了……”
尊严扫地，别说是皇帝，便连普通人都不如。V
