· 军队组织：殖民地联合政府拥有两套不同的正规军队系统，一是由联合政府通过国防部和联合参谋总部最高会议直接统属的联合防御军，二则是各自治殖民地的殖民地政府所统属的殖民地防卫军。
- 联合防御军（UnitedDefenseForce， UDF），直接听命于联合政府的人类统一军队，主要驻扎于各大核心世界与特别核心主权殖民地，在联合政府统一调度下保卫联邦与人类的安全与利益，是当前已知宇宙中规模最大的人类军事组织。
联合防御军有权在战时于核心世界上征召义务役士兵，但在自治殖民地上仅有权招募志愿役士兵，仅在最高级别的全民紧急军事总动员状态下有权向自治殖民地征召义务役军人。
在通常情况下，联合防御军若想要进驻自治殖民地，亦需要获得殖民地政府或是殖民地议会的许可。
联合防御军军种包括：
联合防御行星陆军（UnitedDefensePlanetaryArmy， UDPA），部署于各殖民地星球上的大气层内作战部队，偏向于防御性部队，但在必要时亦可集中投送于其他星球上用于进攻性作战，但不完全适合承担适宜大气圈环境以外环境下的作战任务。
联合防御太空海军（UnitedDefenseSpaceNavy， UDSN），联合防御军用于恒星际太空作战的庞大机动部队，拥有已知宇宙中规模最大的星际舰队之一。
联合防御军星际陆战队（UnitedDefenseMarineCorps， UDMC），与太空海军配合的进攻性大气层内精锐机动作战部队，可以借助太空海军的投送快速抵达已知宇宙中的大部分区域进行作战任务，并且具备充分的承担非适宜环境下作战的能力。
联邦国民卫队（UnitedDefenseNationalGuard， UDNG），直接隶属于各核心世界殖民地政府的防御性地方军队，具有服从于所在核心世界殖民地政府以及联合政府的双重义务，平时通常仅听命于殖民地政府，不受国防部指挥。
因为更多依靠本殖民地的地方财政承担军费，且职能与行星陆军有所重复，国民卫队的装备与训练通常要显着逊于行星陆军，大部分国民卫队没有设立大规模的机动步兵单位，士兵亦未有接受体细胞强化。
- 殖民地防卫军（ColonyDefenseForce， CDF），各大自治殖民地自行组建的殖民地地方军队，拥有完全独立的整套军事体系，相互之间各不统属，通常亦不受联合防御军和联邦国防部统辖，仅在战时会与联合军建立临时的联合指挥机构，不过殖民地政府和议会在极端情况下可以授权将殖民地防卫军指挥权临时移交于联合军，此外在最高级别的全民紧急军事总动员状态下，联合军亦可以获得对殖民地防卫军的部分统一指挥权。
各自治殖民地防卫军平时皆会派出一名或数名顾问参谋长常驻川铎的联邦国防部下属的殖民地防卫军顾问参谋长会议任职，会议会选出三名代表出席联合参谋总部最高会议。
因为各自完全独立，殖民地防卫军在装备、兵力、编制等等各方面之间都存在极大的差异，有的自治殖民地拥有装备水准不逊于联合军的庞大陆军和星系防御舰队，有的自治殖民地仅拥有少量的自卫民兵和轨道巡防队。
而在一些企业自治行星上，殖民地防卫军可能是仅拥有极少量兵力与军事资源的象征性空壳，真正的军事资源集中在各垄断企业的安全警卫部队上，大部分军事防御任务亦实际由后者承担。
· 司法机关：殖民地联合政府的司法机构主要分为联邦法院与殖民地法院两大类别。
联邦法院包括位于川铎的联邦最高法院，以及各星区的联邦星区巡回法庭。
对于大部分联邦公民来说，他们人生中能碰到的绝大部分司法案件基本都会由自己所在星球上的各级殖民地法院完成审理。
