蒋介石分析道，红一、四方面军会合后，兵力最多不会超过五六万人，而分据千余里地区，处处布防，处处薄弱。目下四川各路修碉围困封锁，赤区日渐缩小。区内气候奇寒，粮荒严重，红军在此地区生根不易，固守殊难，最有可能向西北转移。因此，薛部的任务一是堵截红军向西北转移，二是及时在甘南阻击红二十五军。
蒋介石还特别强调，中央军官兵与川军比肩作战时应友好相处，毋存歧视态度，各部队长要以身作则，指导部署。同时，将第三路军第二纵队（胡宗南部）改归薛岳的二路军指挥。
胡宗南部原是十九路军改编而成，有三个师，官兵多是广东人，机动能力强，薛岳指挥起来比较顺手。此时，薛岳在川甘边的堵截兵力相当于13个师，有10余万人。
这是蒋介石入川以来的最重要的一次部署，一方面集中入川的中央军全力在川甘边堵截，企图和红军决一雌雄；另一方面派李韫珩进入西康接受刘文辉防地，企图将来与藏军对峙，显示中央军力已至边陲；同时将川康军改编为国军，逐步结束川军的割据局面。
为了掌握甘肃地势，薛岳率部顶着酷暑烈日，8月13日自江油北行，于24日到达甘肃文昌、武都地区，与胡宗南部取得联络。
这一路走来，尽是崇山峻岭，深谷湍流，羊肠小道，蜿蜒其间，尤为赣湘滇黔诸省未见。官兵们徒步行军，已感困难，军资运输，更成问题。薛岳不得不命令士兵，甚至雇用民夫，用肩扛背驮，确保粮食运往前方。一旦碰上下大雨，河水暴涨，运输跟不上，前方的队伍就得挨饿，有些士兵发牢骚说：“宁愿战死沙场，也不愿饿死山谷。”
薛岳到达贫困的甘肃文县，由于粮食缺乏，也只好以包粟烤饼和稀饭充饥。在此情况下，薛岳、周浑元、吴奇伟、胡宗南等分别向蒋介石诉苦，请组织铁肩队运粮上前方。
铁肩队有两个支队共两万余人，是蒋介石为追堵与包围红军专门组织的一支战略辅助队伍，也是他支持中央军的特殊组织。蒋介石接到薛岳等的请求后，命令铁肩队迅速行动，做好中央军的后勤保障，但因山高路险，气候异常，仍接济不上。
反观红军没任何后勤保障，其长征是如何的艰难。
为了对付红四方面军，薛岳把吴奇伟部和胡宗南部进行联防，构成川西北的“平松防线”，东起古江油关、西经平武八河场（属吴纵队），八河场以西经松藩、包座（属胡纵队）。
胡宗南见红军主力动向不明，非常着急，便派出一个营向毛儿盖进行搜索式侦察。该营遭红军痛击而败撤后，胡宗南不仅不恼，反而高兴。他向薛岳报告说，已大致了解红军的准确地点，他们不可能走草地，一定走松藩，否则自取灭亡。
薛岳因而建立层层封锁线，并做好藏族上层人士的工作，想把红军困死在松藩一带。
9月中旬，由于川军第三路在叠溪封锁红区取得“成效”，红军粮荒严重，蒋介石在叠溪召开有各部队参谋长或高级幕僚参加的所谓“封锁会议”，相互交流作战经验。
蒋介石除规定藏民区坚壁清野外，还恶狠狠地规定两条禁令：一是前线军民有偷运粮食到红区者处死；二是藏民有参加红军者以“通敌罪”论处。
会议期间，薛岳接到蒋介石的秘书长杨永泰的来电说，红军日食野菜，久缺食盐，饥寒交迫，行将瓦解，希转告前线将领最后坚持，“完成八年茹苦含辛，安邦定国之丰功”。谁知没过几天，他又突接到胡宗南来电，该纵队骑兵团在草地边缘搜索，进抵巴西附近发现红军一部已过草地。
薛岳慌了，一面电告胡宗南，速令伍诚仁的四十九师由包座向巴西方面出击，乘红军后续未到前进行猛袭，一面电告大昌加紧布防，别让红军跑了。
蒋介石根本没想到红军会通过几百里无人烟的草地，进行大迂回运动。当得知红军如天兵般出现在班佑河边的巴西地区、大败胡宗南的四十九师后，他怒电薛岳、胡宗南将四十九师伍诚仁撤职，由副师长李及兰升代。
