到了天启三年（1623年），东林党人忽然发现自己的进攻在老头的靠山皇帝面前毫无用处时，心情就开始紧张了。而让他们更为紧张的是，从各种形势来看，魏忠贤的反击理所当然地开始了。
老头和那些追随者商量了好久，决定脚踏实地地来与东林党人开战。他们制定了一个一年计划，首先就是给这些人正名。他们把反对派官僚开列名单，括入百余人，称为邪党，而将阉党六十余人列为正人，以此作为黜陟的根据。魏党一伙的给事中阮大铖博学多才，研究市井小说《水浒传》的造诣相当的高。于是，他给魏忠贤作一《点将录》，以《水浒传》中的聚义领袖的名号排东林党人，如天罡星三十六人：托塔天王李三才、及时雨叶向高、浪子钱谦益、圣手书生文震孟、白面郎君郑郧、霹雳火惠世扬、鼓上蚤汪文言、大刀杨涟、智多星缪昌期等；地煞星七十二人，有神机军师顾大章、青面兽左光斗、金眼彪魏大中、旱地忽律游士任等。
据说，魏忠贤看完这份黑名单后，大喜，连忙拿给朱由校看。朱由校看了半天，觉得很押韵，但不知道什么意思。魏忠贤就指着托塔天王李三才给他讲述了一遍晁盖这个乡村恶霸搬石头的故事，朱由校听完，击节赞赏道：“勇哉！”
魏忠贤发现适得其反了，以后就再也没有给朱由校讲过水浒传的故事。
魏忠贤在行动上的第一步就是将掌权的东林党人和东林党支持者赶出内阁、六部和都察院等重要部门，然后补缺、安插上自己的亲信。我们来看一下当时东林党以及东林党支持者在朝中的分布情况。内阁有叶向高、朱国桢，六部中吏部尚书赵南星、刑部尚书盛以弘、兵部侍郎李邦华、都察院左都御史高攀龙。
这些人在朝中所起到的作用非同小可，可以这样说，如果这几个人同时请假，那么朝廷就会瘫痪。魏忠贤的第一步就是要他们滚蛋，先是鼓动朱由校扣住叶向高的奏折不发，叶向高觉得许多事情如果没有皇帝的签字，他这个内阁首辅就是空的，于是，他请辞。魏忠贤高兴地当即让朱由校允许。叶向高的走让魏忠贤有机会向内阁里塞自己的人，天启三年（1623年）的年末，内阁几成为魏忠贤的内阁了。也就在同时，天启皇帝一面做着木匠活，一面把东厂的大权交到了魏忠贤的手上。这说明了一个问题：魏忠贤已经可以向任何人开刀了。
天启四年（1624年）六月一日，左副都御史杨涟上了影响很大但却没有起到一点实效的《二十四罪疏》，对魏忠贤进行了愤怒的弹劾。最后，杨涟跟天启帝说，知道外面是什么情况吗？老百姓只知道有个魏忠贤而不知有您了。
他这封上疏虽然以事实为根据，但最后一句话却说得不疼不痒。难道他在朝堂之上呆了四年还不知道皇帝的秉性吗？皇帝根本不在乎百姓对自己知道与否，也就是说，他是个低调的皇帝，是个脱离了低级声誉趣味的皇帝。
况且，这一奏疏根本就没有到天启帝那里，而是被内阁扣了下来。据说，当有人给魏忠贤读完，魏忠贤差点没晕过去。有人说这是他害怕了，但这样一个混蛋怎么会知道害怕？就在一年前，他骑着马在皇宫前见到皇帝反而不下马施礼，当天启帝发威，将他的坐骑射翻在地时，他一点都不害怕，还是在别人的“请求”之下去向天启帝道歉了事。
这个连皇帝都不怕的人还怕一个杨涟？他之所以想晕过去，是发现自己才四年时间居然做了这么多坏事，自己都感到吃惊。
但他又不能不按规定办事，也就是大臣的上疏必须要先念给皇帝听，然后再交由内阁处置。魏忠贤叫人念的时候特意删繁就简，总之，能不念的都不要念。可杨涟的上疏中就没有一句对他有利的话，念的人也只好把一些看似在皇帝那里并不是很重要的念了出来。
