可是不久后联邦政府才知道，这种突然降临的病毒他们的专家根本无法解析，无法在短时间内研制出这种病毒的疫苗。这时，生化危机已经在地球上各地疯狂的蔓延起来，于是联邦政府果断的全体撤离，搭乘飞船抛弃地球，地球联邦政府整体移出了地球，同时，他们还不忘带上一些丧尸样本。
由于地球是联邦政府的中央所在，人口流动十分活跃，且各大城市都有星级旅行站，为了防止病毒流传到其他星系，联邦政府十分果断的采用Q弹将地球直接炸毁了。
正当所有联邦公民还没从这突然降临的厄运中反应过来时，已经转移到距离地球几十万光年外的M87星的联邦政府的用于研究生化病毒的实验室原因不明的陷入瘫痪，然后整个实验室都莫名的被病毒感染随后流传出去，M87星继续上演着地球的悲剧，联邦政府发现时已经无力阻止，于是只好如法炮制，禁航令，高层人员继续转移并轰炸掉M87星。
短时间内连续两相同的悲剧分别在地球和M87星上演并以相同的结局落下帷幕，死亡人口超过八十亿，超过联邦连同殖民星在内总人口的十分之一。
数量如此恐惧的死亡人数让联邦公民们坐不住了，组织游行指责联邦政府，要求联邦政府给出解释。可是联邦政府却派军队镇压游行队伍。同时，狄恩的反联邦政府组织在互联网上发表了强烈的谴责，他们指出，联邦政府私下研究生化病毒不甚泄露，漠视公民的生命权将轰炸地球，并在此将病毒携带上M87星，让地球的悲剧重新上演，这种视公民为蝼蚁的做法应该受到制裁！
反、政府组织的申明让联邦公民们联系起一年前那场虫族陨石悲剧，虽然他们都知道幕后黑手就是联邦政府，但是他们却没有勇气站在真理的一方，反而支持联邦政府消灭挺身而出的反联邦政府组织，相当这里，联邦公民为自己曾经的愚昧而感到羞愧。
对联邦政府彻底失望的联邦公民们纷纷想要移民至反联邦政府管辖的星球，可是由于联邦政府和反联邦政府间的星际航线完全封闭，于是暴、动开始了，公民们自发武装起来，攻占星际旅行站，劫持战舰想要加入反联邦政府组织。
联邦政府的地方军区也对联邦政府的做法失望至极，他们支持公民的移民，无视政府的禁航令，甚至有些部队在军官的带领下和公民一起劫持星际旅行站的飞船，开往反联邦政府组织的管辖区域进行投诚。
公民暴、动在各个殖民星上演，一些地方政府甚至公开支持，联邦政府的威望跌落至谷底。为了挽回局面，联邦政府只好针对性的对暴、动频繁的星球采取铁血镇压，虽然表面上让暴、动逐渐平缓了下去，但是联邦政府已经完全失去了民心。
不久一著名财团偷偷将自己的产业转移，架着自己企业的超光速飞船驶向了反联邦政府组织所在的区域。而狄恩的反联邦政府组织热情的接纳从移民而来的公民和财团，在联邦政府民心降至冰点的时刻不断充实着自己一方的人口，发展经济，武装力量。半年内，反联邦政府的军力于联邦政府堪堪持平。
失去了民心支持的政府早晚要被推翻，这一点是毋庸置疑的。于是在第二年，准备妥当的反联邦政府组织集合战舰，对联邦政府发起了总攻。这一点，得到了两方阵营所有公民的支持。联邦政府一方的公民早已深造曹营心在汉，巴不得反联邦政府组织早点攻过来，将联邦政府推翻。
最终的结果显而易先，联邦政府不仅民心尽失，就连军心摇摇欲坠，总攻发起后，投诚的联邦军络绎不绝，反联邦政府的军力首次超过了联邦政府。最后，反联邦政府军大败联邦军，完全推翻了联邦政府，一统所有殖民星并在奥斯洛克星上成立了新的联邦政府。
