然而，此后不久，刚愎自用的世宗帝朱厚熄变本加厉，正式下诏改称生父为恭穆皇帝。大学士丰熙等见状，再次上疏，但朱厚熄还是不听，他们便一同到左顺门一带跪着力谏。朱厚熄更加震怒，竟使用暴力镇压，“命执首八人下诏狱”。消息传出，群情激愤。杨慎便联合同年进士检讨王元正等二百多人，在金水桥、左顺门一带大哭以抗议非法逮捕朝臣。朱厚熄暴怒，下诏将其全部逮捕入狱，并廷杖为首之人，结果死伤十七人。杨慎于七月十五被捕，分别于七月十七日、二十七日被廷杖，每次都死而复生。最终，他被判发配滇西戍边的重罪。
嘉靖三年(1524)八月初，杨慎被押解从潞河上船，经山东、江苏入长江溯流而上，至湖北江陵登陆，经湘西、贵州入滇，然后经南宁（曲靖）、昆明、楚雄，于次年春达云南永昌卫（在今保山地区），行程数千里。《箐口关》一诗，就是1524年12月，他路经余庆司之箐口时写的。
“箐口关何险，山头路更赊。迂回磨转蚁，曲折阵蟠蛇。官舍为孤舍，人家无一家。客心何处切，夕照闪归鸦。”箐口关何险？从波涛滚滚的乌江岸边蜿蜒而上十里之后，便是连绵不绝的高山，及至箐口，但见两峰高悬入云，唯中间数丈之阔的沟谷可通行，今有省道穿越，仍让人产生“一夫当关，万夫莫开”之感啊！试想，五百多年前的山道，不就像是从别人那里赊借而来那样吝啬吗？回望来路，盘旋曲折如盘踞山野的长蛇，行走其间，犹如蚂蚁在转动的石磨爬行。再环望四周，竟然看不到一户人家，只有官府所建的守关小屋孤零零站立在那里。此时此刻，正是夕阳西下时分，乌鸦振着双翅往家里飞去。可是，作者那满含悲愤而又游移不定的心啊，怎么才能找到依附呢……一切景语皆情语。结合杨慎满腹经纶，却壮志难酬，进而入狱受刑、谪戌千里边关等史实读此诗，不禁使人怆然落泪。
正如俗语所言，真金不怕火烧。杨慎真不愧为文人中的真金。政治生涯遭受如此重创，仕途已经走到民尽头，但他良心不泯，正气犹存。到云南后，他发现昆明一带豪绅以修治海口为名，勾结地方官吏强占民田，化公为私，敛财肥己，坑害百姓时，不仅正义凛然地写了《海门行》、《后海门行》等诗痛加抨击，还特地写信给云南巡抚赵剑门，力陈此役“乃二三武弁投闲置散者，欲谋利自肥而倡此议”，希望其制止如此劳民伤财的所谓水利工程。
纵观杨慎的一生，最大功劳还在于，他开拓南疆,使滇西甚至整个云南与中原文化发生了一次巨大的融合。
云南古称滇国,虽在1900多年前即被大汉纳如自己的版图,但多年来“不以内地官守例之”，皆以本土大姓就官，实则为一个封闭的独立王国。就是到了中国疆土最为广阔的元代，其地也为梁王与大理段氏分而治之。所以，当时那里的文化状况,跟西藏、新疆、蒙古的情况不相上下,与中原文化相去甚远。所幸的是，明洪武十四年(1)，朱元璋攻取了云南,在那里建立卫所屯田制度,先后移民汉族人口三四百万到云南,使云南人口的民族结构产生了变化；143年后，这里又来了一位堪称明正德,嘉靖两朝文坛泰斗和学界领袖的杨慎，从而加速了这里的文明进程。时年37岁的他，不间断在哪里开馆讲学,广收学生,孜孜不倦地考察、研究和写作。他攻诗、词、赋、散文、散曲、杂剧、弹词，考论经史、书画，研究训诂、文学、音韵、名物等，因而著述极丰。明万历间，张士佩巡抚杨慎老家四川，将其主要作品收入《升庵集》，编了81卷，包括赋及杂文11卷,诗29卷,杂著41卷。此后，人们又进一步收集他的作品，编辑为《升庵外集》《升庵遗集》《升庵长短句》《陶情乐府》《二十一史弹词》等，共145卷,真可谓汗牛充栋。如此多的著作，再加上他百科全书型的知识结构和不畏强权,坚持正义的强大性格感召力,使得云南各族人民在他之后形成了一股学习中原文化的巨大潮流。
据有关方面统计,杨慎充军云南前,云南只有20余人写有著述，总量不过50种。然，自杨慎入滇到明末的120年间,云南就有150余人写有著作，总计超260种。
