建文二年四月，双方又战于白沟河，李景隆再次战败，燕师乘胜围攻济南。山东参政铁铉固守济南，以逸待劳，燕师久攻不下，败还。九月，朝廷升铉为山东市政使，改命盛庸代李景隆。十二月，盛庸率师与燕军会战于东昌（今山东聊城），燕师大败，主将张玉战死。建文帝于三年复齐、黄职。二月，燕师再度南下。三月，败盛庸于滹沱河，再败吴杰等于藁城。朱允炆以放逐齐、黄为名，使其外出募师勤王。当时，燕师虽多胜，但损失颇重，而朝廷军源颇广，燕军于河北、山东一带所攻下的城邑，兵回后又为朝廷兵所据。同年底，有内臣自京师告密，朱棣知南京空虚可图，决计改变战略，于四年正月率师南下。四月，连破何福、平安师，五月克泗州、扬州。建文帝遣庆成郡主至燕师，乞割地求和，燕王不许。六月，江防都督陈瑄以舟师降燕，燕师渡江，下镇江，直逼南京。谷王朱橞与李景隆开金川门降燕，南京城陷，宫中火起，朱允炆不知所终。
朱棣下南京后，自即皇帝位，下令大索齐泰、黄子澄等建文朝臣五十余人，榜其名曰奸臣，大行屠杀，并实行族诛之法，族人无少长皆斩，妻女发教坊司，姻党悉戍边。朱棣还令尽复建文中所改的一切成法和官制，以表明其起兵目的在于恢复祖训。
此役是明初围绕皇权斗争日趋激化的必然结果。朱棣以强藩起兵夺取皇位后，北方不再有强藩存在。遂继续实施朱允炆的削藩政策，并改革中央行政机构，建立厂卫，继又迁都北京（见永乐迁都），使中央集权得到进一步加强。
【相关评价】
明成祖朱棣是中国历史上一个比较有作为的皇帝。《明史》说他“貌奇伟，美髯髯，智勇有大略.”又说他“知人善任，表里洞达，雄武之略，同符高祖。”似非溢美之词，他确有过人之处。
明成祖是明太祖朱元璋的第四子，初封燕王，镇守北平(今北京)。朱元璋死后，传位给他的孙子允坟，年号建文。“时诸王以尊属雍重兵，多不法。”且欲图害燕王.建文元年(1399年)，明成祖起兵自称“靖难”，四年，破京师(今江苏南京)，夺取帝位，改年号为永乐。是年以北平为北京。永乐十九年(1421年)迁都北京，以南京为留都。明成祖在位22年(1402一1424)励精图治，采取了许多开明而有力的措施，致使国家臻于强盛。略举以下几件事例:
关心人民疾苦。明成祖对各地方官吏要求极为严格，要求凡地方官吏必须深入了解民情，随时向朝廷反映民间疾苦。如永乐十年(1412年)，他命令入朝觑见的地方官吏五百余人各自陈述当地的民情民，还规定“不言者罪之，言有不当者勿问’。对那些饱食终日，无所用心的地方官，对地方民情说不出道道，或知而不言者，要问罪;说得不实在或说错的可以不迫
究。之后，他更严厉地“谕户部，凡郡县有司及朝使目击民艰不言者，悉逮治。”即地方官或中央派出视察民情的大员，如果目暗民间疾苦而不实报的，要逮捕法办。对民间发生了灾情，及时振济，做到“水旱朝告夕振.无有雍塞”。(《明史·成祖本纪}))如永乐三年(1405年)，江苏、浙江等地遭大水灾，人民流离失所。他立即下诏对灾区减免田租凡338万石，“致使流
民复业者十二万余户。”永乐六年(1408年)，京师发生地震.他下令“罢北京诸司不急务及买办，以苏民困。”即命令北京的中央机关，励行节约，对不是当务之急的用费或到外地采购货物等事立即停止，以减轻人民的沉重负担。永乐十四年(1416年)，北京、河南、山东等地发生饥荒，他浪p诏令减免一年租税，还发放粮食13?万石及时振济。(《明史·成祖本纪》)
