同时，日本联合舰队于9月发动黄海大战，重创北洋水师，以不失一舰的代价击毁北洋水师主力舰六艘，彻底掌握制海权。使北洋水师自此蜷缩刘公岛，无力进行远洋作战。之后，日本于1894年冬突破鸭绿江防线，占领大连旅顺，其第一集团军在海军的掩护下，在山东登陆，占领威海炮台，包围北洋水师，终使北洋水师全军覆没。
1895年三月，日本顶住清朝最后反动的海城反击战，并乘势攻克营口，清朝6万大军溃败。自此，甲午战争以日本完胜而告结束。中国损失军力六万人，敌我双方损失比例高达10：1。最精锐的淮军和北洋水师几乎全军覆没。丢失整个朝鲜和大连，旅顺，营口，海城等重要战略城市，清朝签定丧权辱国的《马关条约》，赔偿白银一亿五千万两。并割让台湾。日本将清朝的赔款全部用于军事工业发展中，军事力量迅速膨胀，一跃成为世界军事强国。
而明朝抗倭援朝战争则历时七年，其中主和主战大臣反复争斗，以至拖累前线，使原本形势大好的战争几经曲折，方获全胜。然而就是在内政腐败的情况下，明朝还是最终赢得了战争。1592年四月，日本对朝鲜不宣而战，以闪电战的方式迅速占领朝鲜全境。（不宣而战似乎是日本的管用伎俩）经过明朝内部的几番争论，朝鲜沦陷三个月后，明军才姗姗入朝，却只是祖承训的一支5000人的小部队，结果被日军杀得全军覆没。
为维护颜面，明朝才下决心一战。此战事先并无明确方针，也无精确作战计划，只是随时局变动而增兵，可谓是一大败笔。但是，认真起来的明朝很快打出了国威。四万辽东军入朝后，以迅雷不及掩耳之势直扑日本咽喉，在军队总人数处于劣势（当时日军侵朝军队近20万），集中局部优势兵力发动了平壤会战，在日本增援部队赶到前一举攻克平壤，消灭日军一万五千人。史称平壤大捷。之后，明军经过浴血奋战，将战线稳定在釜山一线。而同时明朝发动的龙山会战彻底摧毁了日本的粮食基地。使日本侵朝的几十万大军陷入了危急之中，并使得日本遣使求和。然而此时，京城的主和大臣石星却力主议和。从而葬送了大好的战争形势。之后明军撤离朝鲜，双方开始了漫长的谈判。
在历时四年的谈判中，日本以拖延手段，赢得了重新准备战争的时间，并重新装备了十五万军队和精锐水师。明朝却对此毫无准备，甚至万历皇帝已经起草好了招抚诏书。然而，在经过充分准备后，日本于1596年九月闪击朝鲜，再次对朝鲜不宣而战。毫无准备的朝鲜被杀得大败。明军也因仓促迎战节节败退，朝鲜大半国土再次沦陷。辽东军只剩万余兵力苦守王京待援。后来明朝派遣6万中央军入朝，明军发动反击，赢得汉江保卫战胜利，随后转守为攻，虽遭蔚山攻击战失败，却也重创日军主力，其后三路攻击，相继收复朝鲜南部主要城市，将日军压迫在沿海几大堡垒中分割包围。
至此日本败局以定。丰臣秀吉在内外交困中去世。日军闻讯集结水师仓皇撤退，被明朝水师在露梁海域伏击。展开了16世纪人类最大规模的海战。经过一天的喋血厮杀，中国水师以损失战船一百多艘的代价，赢得了击沉日本战船四百五十艘的辉煌胜利。至此，日本侵略军已全军覆没，抗倭援朝战争以中国的完胜而告终。
比较两次战争的过程，我们可以发现如下的共同点。
（1）倭寇都是不宣而战，并且在战役的前期彻底掌握了主动权。明朝抗倭援朝战争时，日本水师第一战就彻底摧毁朝鲜水师，掌握制海权，并仅用一个月时间就占领朝鲜大部分战略要地。甲午战争时日本在丰岛打击中国运兵船，并迅速登陆朝鲜本土。在两次战争的开始阶段，中国都是处于不利局面中。尤其是明朝援朝战争，开战时大部分战略要地都是被日本控制，相形于甲午战争开战时清军与日本的犬牙交错，形势更为险恶。
