城门一战过后，有熊部落在轩辕的领导下，开始了漫长的战后恢复。重建家园、安葬死者、安排老弱病残，都出现了轩辕的身影，族人们也渐渐认同了他们的新族长。
也许是轩辕在风伯和闻仲一战中说的话感动了龙族，神龙一族的龙王亲自登门拜访。两人在殿中不知谈了些什么，不过几天后，五十位真仙境界以上的强者加入了有熊部落，部落实力为之大增。
打退了九黎一族的进攻，有熊部落名声大噪，远近各有许多饱受九黎袭扰之苦的部落前来加入有熊。而轩辕这位族长，反击战中的最高领导者，声望也达到了一个新的顶点。
轩辕每日练兵，将从终南山上学来的兵法之道、阵战之道，纷纷运用起来。不过几年光景，有熊实力为之一振，成为继神农部落后的第二部落。
有熊之主轩辕要成亲了，对象是一个聪慧的姑娘——螺祖。
作为人族新一辈的英雄人物，自然有着许多的支持者，尤其是在有熊族内，声望更是无人可比。神农也带着女儿精卫前来贺喜。此时的精卫还是梳着双丫髻，一副十三四岁的小姑娘模样。
左右无人时，精卫瞪着水灵灵的大眼睛问轩辕：“轩辕小师叔，你最近还去海边玩吗？”
轩辕一阵无语，忽然心中一动，装作无意地说道：“很久没去了，你呢？”
“我啊？”精卫脆声说道：“只有每个月十五父亲祭祀时才能偷偷溜去。还是当年和你一起去时好玩，那时候……”
精卫自顾自地说着，忽然发现轩辕并没有认真听自己说话，眼神有些飘忽不定。便说道：“我找父亲去了，不和你说了。”说完，一蹦一跳地走了。
轩辕望着精卫离去的背影，眼中流露出复杂的神色。良久以后，才完全被坚定所取代，目光阴冷地轻声呢喃：对不起了，为了大业，只好牺牲你了……
从怀中掏出一片金黄色的鳞片，虚空印上几个符咒，一捏法诀，便化作一道流光向东飞去。轩辕出神了好一会儿，才回到厅中招呼客人。
东海龙宫，敖海看着手中的物什，心中吃了一惊，旋即又暗自感慨道：最是无情帝王家……这小子果然是天生的帝王啊……看来以后和他打交道要小心一些了。
过来两个多月，一则震动洪荒的消息传来：炎帝神农氏的爱女精卫，在东海中遇害了……
精卫天真烂漫、乖巧可人，几次上岛都颇得人心。又似乎永远是一副长不大的样子，极是讨人喜欢。蓬莱岛上下早就全体出动，四处缉拿凶手。陆久更是在心中自责不已，怎么就忘了这一茬呢？开出了洪荒第一份悬红通缉令——凡提供准确信息者，赐合用先天法宝一件。
洪荒上下动起来了，先天法宝，除了圣人门下，有几人能拥有的？只是却无人能寻到半点线索。陆久抚摸着掌中赤喙红爪的小鸟，叹息道：跟我会蓬莱岛吧，会有你脱劫的一天的……
自从女儿精卫遇难的讯息传来，神农整个人就憔悴了不少，头发越发的雪白，脸上的褶皱更多了，后背明显的佝偻了许过。要不是师弟轩辕赶来帮忙处理事务，还不时地安慰他，恐怕早就支持不下去了。
螺祖是一位聪明的姑娘，这些天来，每天都见丈夫不时露出不安中带着兴奋的神情，心中没来由地一阵担心。却又不敢多问，只能默默为轩辕打理一应俗务。忽然心中一阵悸动，作势便要干呕，恰逢轩辕回来，心中大喜，右手搭上妻子的手腕。片刻过后，少有地大笑出声：“哈哈哈哈……我公孙轩辕有后了~！！！”
从这天开始，轩辕除了每天帮神农处理人族事务，又多了一向例行工作——陪妻子肚子里的孩子聊天。神农闻讯后，强忍着悲痛的心情为螺祖配置补药，确保孩子健康成长。
八个月过后，螺祖顺利产下了一名漂亮的女婴，轩辕取名叫做女魃。
神农看着新生的女魃，居然会常常想起自己的女儿精卫。日夜思念，情绪激荡之下，金仙之躯，居然得了咳嗽的毛病。久经考虑，决定将人皇的位子传给师弟轩辕。
轩辕几番退让无果，也就顺势接下了人皇大位，为人族共主，加尊号——黄帝。
神农救人无数，是开创医药一脉的鼻祖，在人族又政绩卓著，大幅改善了族人生活，应享大功德。吸收了降下的玄黄之气，神农就收拾心情，随前来迎接的伏羲上了三十三天外火云宫。临行前，还叮嘱轩辕道：“师弟天纵之才，当明九黎之害。此事在我和师兄手下都没能解决，就烦劳师弟了。”
