二是南明小朝廷兵部尚书何腾蛟报告称他的手下将李自成斩首于九宫山，但首级丢了。以上两个官方说法因其立场不同而遭到后世的严重质疑。尸体腐烂一说本就不靠谱。
俗话说活要见人死要见尸，并非亲眼所见，怎能说服人相信呢?
再者，李自成在湖北仍有40多万军队。以其英勇果敢的性格怎么会轻易自杀?
何腾蛟的报告更是不足为信，如果将李自成斩首那么这么大的新闻，这么好的邀功机会居然把首级给弄丢了!这很有可能是一个假尸体冒充李自成，立功心切可以理解，但是南明当时已经没有多少战斗力了，想杀李自成谈何容易?
目前关于李自成的死因还有一说是出家，这是影视剧最喜欢的题材，这也是误导大家的最多的一个观点，这种说法普遍认为李子成在陕西夹山寺出家。
乾隆年间在夹山寺发现一幅李自成的画像，这是当地知州亲眼见到的。还有就是1981年发现了石门夹山寺的奉天玉大和尚墓。墓中盛一尸骨和李闯王身材十分相似，陪葬品也是闯王家乡之物。但有人指出质疑，李闯王因后期因战争把眼睛弄瞎了一只，而墓地里的尸骨两只眼睛完好无损，并未失明。
最后一种说法是最为靠谱的一种，也就是隐居一说。建国后在陕西青城镇茨湾村发现了一本康熙年间的《李氏家谱》经过考古专家研究认为，李自成兵败后化妆成和尚逃往陕西后投靠了叔父李斌，后来一直隐居默默死去。
李自成在退至湖北时手握40万大军在九宫山失踪，而九宫山附近也有几万起义军李自成，如果被杀当时九宫山不能如此平静，而事实上当时九宫山却十分安静，没有一点消息。这就是关键!很多研究证实李自成在这时很可能做了一件事，就是故意放出死于九宫山的假消息，而清朝和南明得知此消息后又各自称李自成已死进而打击其士气。
而李自成的下落也就此成为谜团，至今没有明确定论。
难道唐阳羽的出身也是一个谜？
雷州只是一个说辞九宫山才是正道？
