因此，美军的毒气战筹备工作仍在紧锣密鼓地进行着。
这时，因奥林匹克战役的筹备工作，兵站的能力达到极限，美军参谋总部策划部根据上述“奥林匹克战役计划”第六部分的分析，理所当然地提出质疑，怀疑这么做是否值得。
然而，此时参谋总部策划部的质疑已显得微不足道，陆军总部对奥林匹克战役攻击目标的研究工作加紧进行着。
首先，据陆军总部作战部计划，在奥林匹克战役计划第六部分的基础上，在1945年月1了日制定的目标研究“第二草案”中列举出地图上的那33个目标，指出日本防毒设施的弱点，得出这样的结论：在奥林匹克战役中，战略性和战术性地实行毒气战是“有实效的”，而且是“有利的”。
毒气战开始日从登陆作战的3天前起，对日本的港口、海军基地、交通要道(停车场、铁道修理工厂、铁道换车站)、准备登陆的海岸、航空基地、地方军司令部、给养厂和兵器厂等进行芥子气和光气攻击之外，计划对佐贺、福冈、大分、熊本、门司、松山、广岛、吴等城市的中心地区进行以芥子气弹为主的攻击，福冈、八幡等的供水设备，用芥子气进行污染。
接到这一方案后，作战部的MJ约翰逊大校向林肯将军推荐，除九州南部和坨岐、对马、松山以外，对其他城市进行的毒气攻击，应包括东京等六大城市在内，并建议“实施奥林匹克战役，为了达到战略性突破的目的，应尽可能地使用毒气支援作战”。
他主张，如果采用全封闭歼灭战的打法，即使用不着让日本崩溃，也能诱使日本投降，但在这时，美军必须抢先使用毒气。
其次，上述介绍的CWS(化学战后勤部)的目标研究，是以奥林匹克战役计划第四部分为基础而制定的，从1943年到1945年在美国犹他州道格霍伊实验场和巴拿马附近的圣何塞进行的各种毒气使用实验等为基础的、真正的报告。
10月中旬轰炸东京配置用于毒气攻击的航空机，从马里亚纳起飞的B29飞机1架(1个月内毒气弹投下量100吨)，从冲绳起飞的B29飞机232架(毒气弹投下量37120吨)、B24飞机21架(毒气弹投下量7020吨)，光这些战略轰炸机，1个月内就能投下105740吨的毒气弹。
而且，在将会受到攻击的日本城市有3座，报告中还指出了具体的攻击区域。
首先是人口密集的东京，美军将攻击开始日定为奥林匹克战役开始的15天前的上午点，是以“用光气弹战略轰炸市区，进行大批杀伤”为目的。
选择光气，是因为在10月中旬的早晨，在东京的低气温下，芥子气的效果会减弱。
目标从皇居北起，正北到后乐园、六义园、王子车站一带，正东到两国桥一带，以及被围在隅田川西岸的17．5平方英里(44．8平方公里)内，以因空袭而成废墟的文京区为中心，包括神田、上野、浅草、干住、日暮里、田端等。
投下的弹药量，由B29投掷t000磅炸弹5420颗或500磅炸弹2180颗，这一地区的人口94万8千人，估计目标地区风下2英里处的人口是77万千人。
第二是对八幡(户田)战略性使用芥子气弹。
目标是八幡2．8平方英里、户田2．25平方英里的工业区域和人口密集地区，预定在奥林匹克战役开始的3天前下午时起，投下100磅炸弹1874颗。
这一区域内的人口，八幡是15．58万人，户田是12．34万人。
除东京、八幡以外的23个城市，因为受到东京型的光气攻击或八幡型的芥子气攻击，估计整个战役将杀死500万以上的人。
第三，对鹿儿岛市内的日本陆军兵营和军队司令部战术性使用氰氯化物。
攻击开始时间定为奥林匹克战役开始日的上午时，投下1000磅炸弹340颗、500磅炸弹702颗。
这一毒气具有穿透日军防毒面具的能力，估计能使日本地方军司令部失去抵抗能力。
