曾广孝大喜，马上让叶志超带兵进驻汉城，以保护朝鲜王室为由，控制景福宫，只要能将国王李熙和闵妃控制在手里，一旦段祺瑞平息东学党的叛乱，他就可以名正言顺地让朝鲜国王下诏，请日本和俄国退兵。而且叶志超率军进汉城，还可以保护各国驻朝使馆，一箭双雕。
叶志超这个人，向来狂傲自负，他是淮军的老将，此时年过半百，年纪比曾广孝大得多，战功也显赫。叶志超没把曾广孝放在眼里，虽然他也知道进驻汉城控制朝鲜王宫的战略意义，但因为这主意是曾广孝出的，他竟然置之不理，屯兵汉城外的牙山，既不派兵南下帮忙剿灭东学教乱党，也不进驻汉城，每日与诸将置酒高会，日日笙歌。
曾广孝一看叶志超按兵不动，便告知他负责牵制日本驻朝公使大鸟圭介的五千日军，自己带着八千淮军进入汉城，马上派军保护各国使馆，还控制了朝鲜王宫，让李熙下诏，明确拒绝日本出兵；另外，让他发布《罪己诏》：当前朝鲜混乱的局面，都是由于国王的失德和官吏渎职造成，朝廷将承诺改革，满足乱民提出的部分要求：一、停止迫害东学教徒，自愿回乡者既往不咎；二、查明贪官污吏，一律严惩；三、改善起种贱民的待遇；四、不强制白丁戴平壤斗笠；五、允许青年寡.妇再嫁；六、废除一切扰民的苛捐杂税；七、严惩私通日本者
。
这些都是曾广孝根据唐绍仪的报告有针对性地提出的改革，朝鲜国王的《罪己诏》发布后，朝鲜南方民心大稳。
袁世凯也强力镇压朝鲜造反的农民，不到半个月就收复了忠清道、庆尚道，轰死打死日本浪人六百多人，还派兵包围了全州府。内田良平一看情况不妙，加上制造暴乱让日本出兵的任务已经完成，于是赶紧带着浪人撤了，剩下的东学教徒，都是一些衣衫褴褛的农民，朝廷一说既往不咎，他们带着锄头就回家了，东学乱党很快溃散，崔海月最后带两千教民开城门投降，暴乱基本平息。
正当曾广孝觉得大局已定，汉城外传来一阵轰隆隆的炮响，叶志超的淮军和日本驻朝公使大鸟圭介带领的五千日军打起来了。当时中日两军阵地很近，牙山地势较低，日本人积极备战，早修筑了炮台，九门重炮居高临下，占据炮火优势，一阵乱轰。叶志超根本就没想到大鸟圭介这文弱公使，敢凭五千日军单挑他上万淮军，每日照常醉酒笙歌，炮声一响，仓促备战。面对日本人的炮轰，叶志超异想天开，竟然派两千骑兵杀出，企图闪电夺取日本人的阵地。大鸟圭介惊讶之余，命令日军集中炮火攻击，淮军的骑兵跑到半路，就被炸上了天。
淮军骑兵大败，日军反而士气高昂，继续发射杀伤力比较强的榴霰弹，这种炮弹弹壁薄，内装火药及小钢珠或钢箭、钢珠，弹头装有定时引信，能在预定目标上空爆炸，杀伤敌方。
如果叶志超能带领淮军坚守阵地，曾广孝带着城里的淮军杀出，内外夹击，日军肯定大败。但左宝贵一死，叶志超面对日军强大的火力，心理防线竟然奔溃，带一万多名兵狂逃一百多里，退守平安府。曾广孝带五千淮军出汉城，叶志超早已逃之夭夭，他一看叶志超驻防的牙山，连连摇头对袁世凯说：“此处地势低洼，孤险无援，叶志超竟然在此驻兵，真是没用兵常识，天下第一等蠢材，难怪会大败！”
曾广孝默然不语，为了避免更大的伤亡，他决定立即接管叶志超的淮军，把叶志超和一些淮军将领请来营帐中议事，叶志超到了之后，曾广孝马上命袁世凯带亲兵把叶志超五花大绑。叶志超长期习武，体格非常健壮，长着稀疏的胡子，脖子圆滚粗胖，脑袋后面拖着一条粗壮的辫子。
袁世凯带着两个亲兵，费了九牛二虎之力才把他按倒在地。
