据不完全统计，印尼自内战爆发以来已造成数千人死亡，上百万人流离失所，而且数目仍在扩大。经济损失更是数以千亿美元计。
几十年来的经济成就毁于一旦，绝大部分的人的生活水平和质量，甚至连二十年前都远远不如。食不果腹的也不在少数。
因此每一个印尼人都希望战争能快点结束，而这也是之前爆发全国大规模游行示威的原因之一。
在这种情况下，哈比比自然要顺应民意。
自接替苏哈托成为印尼的第三任总统以来，虽然只是过渡总统，但他依然忠实的履行自己的职责。积极与几大分离势力对话。
首先是‘自由巴布亚运动’提出了停火条件——印尼当局必须承认西巴布亚的独立和主权。
这是基础。也是前提，只有印尼当局接受了这个前提，‘自由巴布亚运动’才会跟印尼谈其他的东西。
随后‘自由亚齐运动’也提出了类似的条件。
这一下子让哈比比这个过渡总统陷入了两难之中。
如今印尼国内大大小小的分离势力有近二十个。但真正成气候的也就几个。而‘自由巴布亚运动’和‘自由亚齐运动’又是其中最强的，俱都拥兵数万，且装备先进。许多种装备就连政府军都没有。
可以这样说，只要消灭了这两股势力，其他的势力政府军完全有能力扫灭，只是时间早晚的事。
但问题就在这了。以政府军现在的能力根本无法消灭这两股，别说打游击战，就算是正面战场也不一定能打赢。
那该如何结束内战？
哈比比提出的方案是给予亚齐省和西巴布亚省高度自治权，印尼中央政府只负责外交和军事。
但被自由巴布亚和自由亚齐断然拒绝了。
自由亚齐更是在随后展开一次大行动，加快了对西苏门答腊省的进攻，大有占领西苏门答腊省之势。
自由巴布亚倒是没有大行动。因为自由巴布亚已占领整个西巴布亚省了，要想扩张就必须渡海，这是自由巴布亚不具备的。但其手中却有数千政府军士兵做筹码。
10月7日。也就是自由亚齐对西苏门答腊省大规模进行的第二天，哈比比在总统府召集了各反对派的领导人。包括梅加瓦蒂。
目的是讨论是否要接受自由亚齐和自由巴布亚的停火条件。
会议一开始气氛就达到了巅峰。
有人认为该接受。有人则极力反对。
认为该接受的人出发点非常简单——只有结束内战，印尼才能真正恢复稳定。经济也才能重新回到正轨。同时他们认为，如果战争继续进行下去，政府军战败的可能性非常大，因为国家的经济已难以支撑。而对方背后却有强大的势力支持。
反对者的理由更加简单，也更加慷慨激昂——亚齐省和西巴布亚省都是印尼领土不可分割的一部分。
两派的争吵充满了火药味。
最后以‘认为该接受’的人胜出而告终。因为在争吵的最后，梅加瓦蒂站在了‘接受’的一方。
10月9日。印尼外交部召开新闻发布会，外交部长出席了发布会：“这这个结果并不是我们愿意看到的，但局势已经到了这个地步。曾经的印尼到处充满了活力和生机，然而如今呢？除了千疮百孔，就是一张张绝望的脸庞。我们必须改变这一切。因此尽管这是一个艰难的决定，但我们依然要迈出去，只有这样一切才有重新开始的可能。”
在接受了自由亚齐和自由巴布亚的停火条件后，政府军并没有就此停下。他们开始把大部分兵力抽调出来，用于对付那些小的分离势力，而这也是哈比比制定的计策。
10月13日，中国向安理会提交方案，方案要求印尼尽量与‘自由亚齐运动’和‘自由巴布亚运动’进行和平谈判。避免更加严重的人道主义危机。同时要求联合国派派遣观察员，监督双方正式签署停火协议，并持续监督停火协议的执行情况。以切实达到停火目的。
这是中国成为安理会常任理事国以来，第一次向安理会提交方案，而且还涉及到了主权国家。立刻引起了国际媒体的广泛关注。
经过两轮讨论，安理会以11票赞成、4票弃权通过提案，其中常任理事国中法国和美国弃权。
10月15日。印尼政府表示同意联合国派遣观察员。
