后来由于海禁政策，水师船备废弛，官办船厂居然连400料中型福船都造不出，需要征召民用福船改装以应对倭寇。
不过后来发现，民用的福船和广船因为需要走远洋贸易的原因，造的往往比官船还要坚固。
自抗倭名将俞大猷适时提出“海战不过是以大船胜小船，以大铳胜小铳；以多船胜寡船，以多铳胜寡铳。”以来，明代的海战很早就进入了近代的模式。
在嘉靖年间，明军的战船一半的战斗人员都使用火器，而且火炮的口径越造越大。
至万历年间，甚至有红铜铸造的万斤重炮上船的记录，后世估算大约相当于欧洲的24磅重炮。
自1520～1580年一系列与外部的冲突后（主要是与葡萄牙和荷兰），大明水师模仿欧洲桨帆船的做法，把重炮安置在船头；一开始重炮被摆在蜈蚣船（桨帆船）上，后来连中大型的战船船首都安上重炮。
以《效纪新书》上的一号大福船为例，船首会摆上1门大发熕。
至此大明水师得到一种比较有效摧毁敌方船只的方法，海战战术也为之改变；遇敌先抢占上风，用舰艏重炮攻击敌船，然后航向敌人右侧发射左舷的大佛狼机、百子等小炮射击舰上人员；接者发射舰艉炮，然后回转到敌人左侧发射右舷的大佛狼机与百子炮，然后从下风处再来一次。
注：发熕由1548年传入，铜制或铁制，多数重300～500斤，少数有破5000斤，为当时东南沿海火力最强的舰炮。
很多文学好影视作品中，对于明朝水师的描述多少因为禁海而想当然的弱了，事实上如果明朝水师真的这么弱不禁风，又怎么可能在明末时候还有余力去收复台湾呢？
秀家最不愿意看到的就是明朝水师参战，以日军水师的势力，历史上对付朝鲜的龟船尚且力有不逮，面对与葡萄牙等西方列强交战过的大名水师哪里够塞牙缝的？
就算秀家现在最强的2艘克拉克帆船，明朝水师又不是没有击沉过，人家荷兰东印度公司好歹装备着几门24主磅炮。
秀家的卡拉克帆船上面最大口径火炮就是左右各3门的18磅青铜炮，其他15门都是12磅火炮。
至于福船更比不说了，4艘福船船头的18磅炮还是从两艘卡拉克船上拆下来按上去的，左右都是明治火炮，口径大约在6磅炮之上12磅炮之下的水平。
就要是这对上明朝水师，秀家就算把全部家底赔进去都不够看的啊！
