处理西凉董卓旧部时，他先是想全部赦免董卓的部下，可继而又对群臣解释说：“本来，他们是没有罪的，只是身不由己，跟随董卓，所以不得已听从董卓差遣，犯了错误。现在如果给他们突然加上恶逆的罪名，而且特定赦免他们，恐怕反而使他们猜疑恐惧，心理承受不了，所以，赦免他们无罪不是使他们安心的上上之策，还不如让他们承受惩罚。”
凉州兵是董卓的嫡系部队，战斗力强，而且对董卓很忠心。董卓死后，如何处置凉州兵，是关系王允本人和东汉政权的大事。王允企图削夺凉州兵将领的兵权，取缔全部凉州兵，并且计划利用关东兵去控制他们。
可是后来有人对王允说：“凉州兵素来害怕袁绍，畏惧关东兵，而今，如果派关东兵去解散他们，凉州兵人人都会担心性命不保，这样，很容易引起兵变和混乱。还不如任命皇甫义真为将军，去担任凉州的统帅，并让他长期留在那儿，以便安抚军心。”
王允一听坚决反对，现在他可不想让人抢了他的风头，尤其是皇甫嵩这样的汉室重臣，要不然如何凸显他的重要性呢？他当即反对：“这样绝对不行，关东兵是反董卓的义兵，与我们是同一条路线，现在董卓已死，如果继续把他们屯驻在险恶之地，虽然安抚了凉州兵，但是关东兵将领会疑心我们不重视他们。”
注意！这时候出现了一个人，号称“毒士”的贾诩、贾文和！他对当时掌握两只最强大的西凉军势力，李傕、郭汜说：“你们要是现在逃跑，到时候一个亭长都可以抓住你们，不如放出风声，集合凉州所有兵马，反攻长安，就算不成功，到时候兵马在手，长安也不敢太过逼迫，那时候在走也不迟。”
正是这个计谋，让长安陷入了长达数年的混乱，不知死了多少人，毒士之名，他贾文和当之无愧！为了活命，这是个敢于冒天下之大不韪的人；
李傕、郭汜听从了他的意见，放出风声：王允要解散凉州军团！
凉州百姓听到王允想解散凉州兵的风声后，便到处传言，说王允要杀掉所有凉州人，一时之间，整个凉州人心惶惶，一片惊慌。凉州兵将领本来就成了惊弓之鸟，对自己的前途深感忧虑，当他们得知王允要削夺他们的军权，解散凉州兵的消息后，更是惊慌。
绝望的凉州兵寻思：反正是一死，不如死个痛快。于是他们迅速召集军队，严阵以待，准备见机起事，并且互相传告：蔡邕只不过受了董卓的一点厚遇而已，王允便不分青红皂白地把他杀了。对于我们，不仅没有丝毫赦免的意思，反而想剥夺我们的兵权，置我们于死地。我们除了联合起来，别无选择。
最终在李傕、郭汜两人为首脑的带领下，凉州军团反攻长安，十余万凉州骁健攻破长安，吕布双拳难敌四手最终在并州军团的维护下护送家小不知去向，而王允这时候表现的很有骨气，慷慨的就义身亡了；
在这一通动乱下，有几个人的动态很有意思，首先是董卓的女婿牛辅被他的手下胡赤儿杀了，夺了他的家财投奔吕布，吕布很反感这样的人，又把他杀了；
李肃，这个舌灿莲花的男人，因为抵抗李傕、郭汜的战役中，表现的不好也被吕布杀了；
李儒，董卓的另外一个女婿，却不知所踪，凭空消失了！
王允也死了···
东汉王朝的最终灭亡是不可逆转的历史必然趋势。处于这一具体历史背景下的王允，满怀挽救危难局势的才能和雄心，并不断努力奋斗。他杀贼有功：不仅稳定了政权，而且还在一定程度上缓和了东汉末年诸多危机的总爆发。
然而，在继续恢复大汉雄风的努力过程中，王允失败了，除了客观上不可抗拒的原因之外，也有他本身的主观失误。虽然东汉王朝最终逃脱不了倾覆的命运，但是，王允在力图改变这一命运的过程中所起的缓冲作用，却是不容忽视的。
