南明小朝廷被端后，马士英带着残兵到杭州绍兴一带打游击，阮大铖投奔鲁王和隆武政权先后被拒，最后被老同学朱大典收留。朱大典和阮大铖是同科进士，在敛财上和阮大铖一样都是天才，所以有资本自己拉起一支队伍。和阮大铖不同的是，朱大典死脑筋不肯投降，最后清兵攻破金华，朱家的女眷都跳了井，男的都围坐在朱大典身边，朱点燃引线，一声巨响一了百了，非常悲壮。
在朱大典处待了没几天，金华人就不干了，说金华以香喷喷的火腿闻名，你老朱弄了个姓阮的臭豆腐在这供着，不行，轰走。朱大典没办法，就把阮大铖送到了钱塘江分部。钱塘江是要津，阮大铖知道此地的重要，于是“潜通降表于北，且以江东虚实启闻北师，在江头为北师间谍者几一年，而越人不知也。故后录用降官，有‘大铖投诚独早’之旨”，张爱玲说成名要趁早，阮大铖说投降要趁早，都是人生“圭臬”。不久清兵攻破钱塘江防线，阮大铖就顺水推舟地投降了。随后阮大铖就把朱大典给清朝的“开国大典”献礼了，阮大铖先是写信劝降，被朱大典撕了，清军随即攻城，金华城墙太厚，炮轰了半天也没动静。据说就是阮大铖献的策，他告诉清军金华西门是新夯的土，最薄弱，一轰之下果然破城。接下来就是开头那一幕了，所以朱大典比阮大铖名声好一些，死后还得了个谥号：烈愍。
降清后的阮大铖非常讨清军喜欢，有个清军将领求知欲很强，阮大铖就教他吟诗作对，以他的水平给满洲武人上课，跟教幼儿园差不多，没几天就收了一堆少数民族学生。清军吃的军粮粗糙，阮大铖就让手下采办蔬果肉食，找自家的厨子烹饪，香气把站岗放哨的都吸引过来了。吃饱喝足，清军带兵的贝勒听说他有个阮家班，唱戏唱得贼好，就问阮大铖会不会，老阮就亲自“执板顿足而唱，以侑诸公酒”。满人都是东北那旮旯来的，听不懂南方话，阮大铖就改唱弋阳腔，清兵听了都说：老阮你说你咋整的呢？老阮你太有才了。
有关阮大铖的死，版本很多，相对较靠谱的是张岱的记载。他的《石匮书后集》中关于阮大铖之死记录得相对详细：“随征金华，城破，大铖搜朱大典外宅，得美女四人，**纵欲。过仙霞岭，中风堕马，已不能言，咋舌而死。”舌头都伸出来了，多半是脑溢血。吴伟业记录的略有不同，清军攻打衢州前，领兵贝勒见他满脸浮肿，就劝他原地休息，等回来的时候再接他，阮大铖怕丢了将来的官位，就说：“福建巡抚已在我掌握中，诸公为此言得毋有异意耶？”别人又劝，他就扯着嗓子吼，顺便表明一下自己中气十足，“我何病！我年虽六十，能挽强弓，能骑劣马，我何病！”贝勒爷一看，既然你这老家伙逞能，就一块走呗，死半道上可别怨我。到仙霞岭，其他人都骑马上山，阮大铖想表现自己很强悍，就牵着马登山，还指着旁边的清兵说，你看，老子我的身子骨比小青年还强十倍呢。说完噌噌地往山上爬，要做第一个登上峰顶的人。结果，他赢了。
清军登顶后，见“大铖马抛路口，身坐石上。呼之不应，马上以鞭挑其辫，亦不动”，死了。
上世纪七十年代黄裳先生读过阮大铖的《咏怀堂诗》之后，写了篇散文，因为引了一句国学大师王伯沆的话，被领导呵斥一通，那句话是“乃知小人无不多才也”。知道了吧，三十多年前表扬奸臣有才华也是桩罪名。后来阮氏诗集《和箫集》被发现，黄裳先生曾想买下，不卖就抄下来，结果被政治素质过硬的人告发，遭到批判，这回的罪名是“对一个历史上的大坏蛋寄予了爱慕和同情”。
其实早就有人表扬阮大铖了，陈寅恪先生，还有他的父亲陈散原，都认可阮大铖在文学与戏剧两个领域的才华。陈寅恪还提到了阮大铖的两本戏，“至所著诸剧本中，《燕子笺》《春灯谜》二曲，尤推佳作。其痛陈错认之意，情辞可悯。”此外他还论述了阮大铖后期行为的成因，认为东林党人对他苛之太甚，“此固文人文过饰非之伎俩，但东林少年似亦持之太急，杜绝其悔改自新之路，竟以‘防乱’为言，遂酿成仇怨报复之举动，国事大局，益不可收拾矣。”这段话出自《柳如是别传》，比黄裳“过分”得多，不知陈寅恪先生为此挨过批斗没有。
章太炎也高度评价阮诗，认为明朝能跟他水平相当的没几个，并举例潘岳、宋之问这二位的屁股未必比阮大铖干净，但诗文也都传世了，“君子不以人废言也”，因此发掘秦桧、严嵩、阮大铖这些“大奸大恶”的遗作，不是什么给坏蛋张目的行为，属于正经的文学考古。
阮大铖在戏剧创作上绝对是一天才，终其一生他总共写了十一个剧本，如果都流传下来，相当于三分之一个莎士比亚，可惜流传下来的只有四种，《燕子笺》《春灯谜》《牟尼合》以及《双金榜》。先不说质量，单说写作速度就把现代编剧比没了，《牟尼合》总共三十六场，阮编剧半个月搞定；《春灯谜》三十九场戏，一个多月就写完了。那时候的昆曲火得一塌糊涂，往往阮大铖刚写完几场就拿去排演，要不是手快还真接不上。当时的观众都是阮剧的粉丝，连阮大铖的死敌复社诸位公子也爱看，只不过这几位粉丝太难伺候，上文有述，不重复了。
香港的几位电影大腕都有自己的班底，比如成龙的成家班，洪金宝的洪家班，都是人家阮大铖玩剩下的。当年阮大铖养了个“阮家班”，只唱自己写的戏，这几乎是后世所有编剧的梦想，却不知人家阮老板早在明朝末年就实现了。阮大铖的哥们儿、写《夜航船》的张岱多次欣赏过阮家班的表演艺术，看完给了“五个出色”的至高评价，认为阮大铖的戏从剧情、角色、唱词到唱功、扮相无一不精妙。另据观众之一的冒襄记载，阮家班演一出戏的门票是十六两白银，寻常人家是看不起的。
张岱还把阮大铖定位为现实主义戏剧大师，“骂世十七，解嘲十三”，顺便在戏里夹枪带棒地骂骂东林党，相当解气。不过螳螂捕蝉，孔尚任在后，阮大铖想不到自己也会被人写进了戏里，而且还是反一号，《桃花扇》里的阮大铖构陷侯方域，拆散侯和李香君，形象相当不光彩。而侯方域在他的《李姬传》里，借女子之口又把阮大铖灭了一道。这就叫世道轮回，报应不爽。
