当天，苏太守亲到两浙兵马都监刘季孙府上和他商量调兵修湖的事。刘季孙一来也有心为杭州出力，二来看着苏轼“两浙路钤辖”的面子，当即答应拨五百兵士协助清淤。
也在这一天，主簿苏坚写好告示贴了出去：凡杭州府周围百姓强壮有力且无活计的，都到官府报到，参与清理西湖，每人每天管两顿饭，给钱五十五文。
这时杭州附近灾荒刚过，百姓尚穷，衣食无着的人很多，看了告示，无数人蜂拥而来，都愿意为官府做工，很快招了一千多人。同时都监府派出的江防兵三百、船务兵二百也到了，两千人一起动手清理水草，开挖淤泥。
这时，苏太守请求拨钱粮开湖的札子已经递进京师，他自己也搬到钱塘门外的大佛头山办公，从窗户就能看到湖上挖泥修堤，听得号子声声，心里这才踏实。
苏轼在杭州疏浚西湖，所求款项实在不多。恰好就在苏轼递进札子的时候，他弟弟苏辙刚从翰林学士“降为”御史中丞——实则受太皇太后器重，以“明降暗升”的办法把持了朝廷中最要紧的御史衙门，朝臣们拍苏子由的马屁还嫌来不及。见苏轼要一万石米开湖，很快照数批了下来。
有了钱粮，又有实心办事的官吏，西湖工程办得异常顺利。三个多月淤泥已经掏清，用湖泥堆砌出来的一道南北长堤也渐渐成形。这时子珪和尚又跟苏太守商量：“西湖虽经修整，以后难免不再淤塞，大人应该想个长久的办法才好。”
苏轼就问子珪：“大和尚有什么好办法？”
子珪忙说：“贫僧想了个主意：大人可以把西湖近岸处的水面划出来租给人种菱角。种菱角的人最恨水草，为了得个好收成，他们自然会把湖岸边清理干净。只要湖里不生水草，西湖的问题就解决了一半。”
子珪这个点子果然不错，判官杨蟠正好在边上，一听这话也有了主意，笑着说：“大和尚这个办法好，我又想到了：咱们把湖面租给人种菱角，当然要收租金，到时候可以用这笔钱雇请专人清理湖面，也是好事。”
子珪和尚会治水，杨判官会赚钱，说的都是好主意。苏轼听得连连点头。
子珪和尚又说：“西湖经过这场整治，估计一百年内不会有大问题了。可一百年后仍然难免淤塞，到时候杭州未必能有像大人这样的好官肯为百姓清理湖水。但西湖已经整顿到今天这个地步，就算官府不管，百姓们也会凑钱清淤。贫僧认为太尊应该趁着掏湖的机会，在湖心最深处留个记号，让后人知道早先湖水深浅，再清淤时就可以此为标记了。”
子珪和尚不但精通水利，为人也最老成可靠，凡整治西湖的事，只要大和尚发话，苏轼无不听命，立刻就说：“大师觉得标志如何立法？”
子珪想了想：“就在湖中最深处立三根木桩，每根木桩插入湖底三丈，高出水面一丈，打上刻度，后人就知道水的深浅了。”
子珪和尚是出家人，他这个主意虽好，未免过于朴素。苏轼想了想：“若只是三根木桩未免太平常了。杭州乃是东南佛土，五百禅林，就把西湖里的标记雕成三座石塔如何？”
苏轼一生亲近佛法，所以会有这个念头。子珪和尚听了十分高兴，冷峻的脸上难得露出笑容来：“大人这个主意好。”
一事不烦二主，苏太守就对子珪说：“大和尚想必认识出色的石匠，雕凿佛塔的事就请大师去办吧。”子珪立刻办事去了。
这时淘出的湖泥已经渐渐砌成大堤，早先规划的六桥、六码头也有了雏形。苏太守亲自给六桥定名为映波、锁澜、望山、压堤、东浦、跨虹；六码头分别通向赤山、麦岭、花家山、茅家埠、曲院、耿家步。
六桥之名定下的时候，堤南映波、堤北跨虹二桥已经开始建造。湖心的三座石塔也已雕凿完工，每座石塔相隔二十丈，底下打着松木桩，插入湖底两丈有余，三座小小石塔正好露出水面，高约七尺，上为玲珑剔透三层葫芦宝顶，下层是个圆球，中间缕空，开有五孔，入夜后可以在里面点起灯火，既防游船碰撞，又是一道景致。
