张居正去世不久，反对派在倒张的同时，连带着秘密提醒万历皇帝：戚继光是伏在宫门外的一头猛兽，他只听从张居正的调遣，别人无法节制，倘不提防，极有可能使其谋反。而作为手握重兵，捍卫京都门户的“戚家军”一旦谋反作乱，后果不堪设想。
戚继光像
万历闻听，深以为然。为防后患，他当机立断，把驻守华北重镇、京都门户蓟州的总兵官戚继光调往广东任总兵官。因为一时还抓不到戚继光谋反的把柄，又怕过激处置引起兵变，万历及反张派都认为这样做是最好的权宜之计。戚继光只身赴广东上任，官职依旧，但实际上已经失去了捍卫京都的重要地位，也失去了朝廷的信任。这一点，戚继光与他的同僚好友洞若观火，明白无误。因而，调往广东之后的戚继光，处境尴尬，如同一只猛虎被赶进了松软的沙滩，很难再有大显身手的机会。但这时的戚继光作为一员武将，只是在精神上感到消沉郁闷，并未完全意识到处境的严峻，直到清算张居正达到**的第二年，他才猛悟到局势的严重程度已关系到自己的身家性命。受幕府策士指点，为避杀身之祸，戚继光很快向朝廷呈交了离职疏文，实指望早日交出兵权，以绝朝廷及反对派对自己的猜忌。遗憾的是，迅速发展的时局已不允许他做出如此聪明的选择，既然他被视为张居正的同党和朝廷的心腹之患，等待他的自然是一场悲剧。很快，戚继光作为张居正的党羽而受到参劾，万历皇帝见奏，毫不留情地将其革职，并将他的部下将领胡守仁、朱钰、金科等人，或革职或发戍边疆，以此斩草除根，断其后患。
戚继光编著的《纪效新书》与《练兵实纪》书影
戚继光落得这个结局，当朝官宦没有人感到奇怪。既然这颗将星是由于张居正的庇护和支持得以冉冉升起的，并由此照亮了大明王朝的边陲，那么，在张居正营筑的权力大厦崩溃之时，他就理所当然地摔落下来，是谓倾巢之下岂有完卵？用四百年后的时髦话说：雪崩时，没有一片雪花是无辜的。
戚继光设计的军旗，上面运用了星占学和民间传说中的符号与动物图案，意在激励这支由农民和矿工组成的军队的士气
当然，这位“一剑横空星斗寒”的名将突遭革职，也有正直的朝臣表示出内心的不平和同情，尤其对“戚家军”的解体，表示出极大的忧虑：这曾是一支怎样的钢铁部队，它在抗倭和捍卫京师的风风雨雨中，为飘摇的大明王朝立下了何等的战功？赢得了多么显赫的声名？一支帝国最优秀的军事力量，就这样随着戚继光的革职而土崩瓦解，实在令人不舍和寒心。从戚继光留下的军事著作《纪效新书》中，不难看到他是怎样建立起这支铁军的。这位自小生长于山东沿海的武举人，在移驻浙江并经历了一连串同倭寇的作战之后，终于做出了具有历史性的决策——创建“戚家军”。从戚继光宣布招兵办法、规定月饷数字、拟订分配兵员职务原则、明确官兵职责，到设置队、哨、马的各级组织，以及统一武器规格、颁发旗帜金鼓等一系列措施和方略来看，这位年轻的将军具有极高的军事修养和以身示范的献身精神。而他创立的“鸳鸯阵”“两才阵”“三才阵”以及“连坐法”，又使这种军事天才发挥到极致，并赋予这支军队以钢铁的纪律和战无不胜的气概。
