成化四年（1468年）六月，英宗皇后钱氏崩。为葬钱氏，宫廷内曾有过一场不小的论争。从明朝开国皇帝朱元璋创立一帝一后的葬制后，其下的几代帝后均按此制度执行。至英宗朱祁镇，见皇后钱氏无子，为避免死后发生纠纷，临死前留下遗诏：“皇后钱氏，名位素定。当尽孝养，以终天年”，并要钱氏死后同他合葬。宪宗皇帝即位，因他是皇贵妃周氏所生，故又封生母为皇太后，在葬钱氏时，周太后想，从大明洪武至仁宗，陵内均是一帝一后，如果钱氏葬于英宗的裕陵，自己寿终后就不能与英宗合葬了，因此主张把钱氏另葬别处。
消息传出，举朝震惊。群臣以英宗遗诏为据进行抗争，但周太后仍不改初衷。群臣见上疏无效，就跪在文华殿前哭诤。宪宗朱见深见群臣伏地不起，便提出将玄宫分成三殿，这样既能葬钱氏，也能照顾母亲周太后。事情既然发展到如此程度，周太后只好答应。但又别出心裁，提出一个条件，要把钱氏入葬的左殿隧道口堵死，只让将来安放自己的右配殿和中殿相通。埋葬钱氏时，朱见深按母亲的要求做了。所以裕陵地宫，左右配殿一塞一通。朱元璋之后的一帝一后的葬制，从此便被打破了。从这段史料分析，地宫的左右配殿是安放皇后的。
万历皇帝也曾想打破此制度，万历二十五年（1597年）皇贵妃李氏崩，他传下口谕：“我念皇贵妃李氏，侍候我好，又生有皇子，应安葬在寿宫右穴。”但被大臣以无妃嫔葬寿宫为例阻拦，没有成功。当时万历皇帝何以置祖制于不顾，传此口谕，其用心尚不清楚。最后结果是把李氏葬在定陵以南的银泉山下。既然地宫左右配殿专为皇后设置，为何定陵玄宫的配殿空**无人，而两个皇后的棺椁却都放在了后殿？
定陵发掘时，考古人员在玄宫后面的宝城内侧，发现了刻有“左道”“右道”的字样。从字迹的用意分析，应是通往左右配殿中，也就是这两殿的隧道入口。因为没有发掘，只在里面看到石门和门外的金刚墙，其隧道的具体形状尚不清楚。当时推断，这两条隧道应是皇后棺椁的入口。那么，两位皇后的棺椁进入陵园后，应先绕到玄宫之后，沿两条隧道分别进入左右配殿。但帝后入葬时，正处在大雨季节，“玄宫不可久泄”，整个地宫只挖开前方的一条隧道通往前、中、后三殿，配殿隧道没有打开，这时的皇后棺椁，也只好跟随万历皇帝一起从正门隧道运往玄宫。进到中殿后，由于通向配殿的甬道狭窄，巨大的棺椁无法进入，匆忙中只好将两个皇后的棺椁都运往后殿，跟万历皇帝“同床共寝”了。
既然两条甬道不能通行棺椁，那么如此设计又有何益？
从皇帝生前筑造豪华的寿宫来看，无非是相信灵魂不灭，人死后灵魂依然像在人间一样生活。配殿中设甬道和正殿相接，正是为了帝后的灵魂在宫内相通，彼此恩爱如故。这一点从裕陵地宫配殿的一通一塞，便可窥其一斑。
谜团已经解开，但似乎又不尽人意。新的谜团仍缠绕着后来的研究者和挖根问底的观光人，生出一个个疑问。
孝端皇后四月病故，其棺椁应已俱备。六月玄宫被打开，直到十月三日，她的棺椁才和万历皇帝的一起运进玄宫。玄宫内甬道狭窄，皇后的巨大棺椁不能穿过它进入配殿，在长达三个月的时间内居然无人想到是不可能的。既然已经想到，为何又不开配殿的隧道，以至破坏帝后葬制呢？这就不能不提出一个新的问题：定陵玄宫内的配殿，是不是专为妃嫔设计的？
