莫洛死后，其部为王辅臣所并，王辅臣旋派使持书往见吴三桂，表示愿随反清，接着引兵北返，至沔县，闻洞鄂率满营骑兵至，巩势孤难敌，便与总兵蔡元、副将白光勇等率部进入陇右，洞鄂闻莫洛死，不知其详，亦不敢战，率部北返西安。
王辅臣兵变给康熙很大的震动，这样，原来的部署全部被打乱了，且王辅臣一旦和吴三桂联手，将会对整个局势产生严峻的影响，甚至威胁清廷。为此，康熙做了充分准备，先是派王辅臣之子王吉贞进行招安，希望王辅臣能幡然醒悟，并表示对他既往不咎，王辅臣看到康熙的招降书后，又担心康熙秋后算账，于是在回复中要求朝廷派使臣重申保证其无罪。
康熙看出来王辅臣是有意拖延时间，他一面派了定西大将军贝勒董额和陕西总督哈占据守近郊，一面派人继续到王辅臣处招安，并再次宣他无罪。果然，王辅臣看见吴三桂进展迅速，已经被吴三桂当下的形势迷惑了，两股势力很快集结，导致西北局势恶化。清廷经过艰难的战斗才勉强将局势扭转，但前线指挥不力，导致平凉整整打了一年都未能攻下，后来，康熙起用了经验丰富的图海为抚远大将军。
图海，马佳氏，字麟洲，世居绥芬河（今黑龙江省东宁市）人，隶满洲正黄旗。清朝初期名将。
图海天资忠悫，性情敦笃。顺治二年（1645年），起家笔帖式，迁国史院侍读。顺治八年（1651年），擢内秘书院学士，迁弘文院大学士、议政大臣。顺治十二年（1655年），加太子太保、刑部尚书，因事夺官。康熙帝即位，起为正黄旗满洲都统。康熙六年（1667年），拜为弘文院大学士，加一等轻车都尉世职，充《世祖实录》总裁官。康熙九年（1670年），改中和殿大学士、礼部尚书。康熙十三年（1674年），随信郡王鄂札平定察哈尔叛乱。
康熙十五年三月，图海抵达平凉，“明赏罚，申约束，军威大震，贼众闻之惧”。诸将请乘势攻城，图海说：“仁义之师，先招降然后才攻打。我凭借皇上的天威，讨伐这些凶残的逆贼，不用担心无法攻克。顾念到城中数十万生灵，他们没有一个不是朝廷的赤子，如今惨遭叛贼劫掠到这种地步，覆巢之下，杀戮一定很多。等待他们主动投降归诚，用来体现圣主好生之德，不是更加美化吗？”城中军民听说后，莫不感泣，多有自相出城者，因此人心动摇，叛军的形势江河日下。图海在未开战之前，先用感化人心之术，效果是十分明显的。
为了打下平凉，图海与总兵官孙思克等对虎山墩进行了巡视。虎山墩位于平凉城北，高数十仞，是通往西北的饷道。图海看了后说：“此地是平凉的咽喉，得到这个饷道，那么此城可以不攻而下。”正在巡视中，有王辅臣兵万余突来迎战，布列火器挨排。图海立即指挥军队分路还击，自巳至午，越战越勇，叛军被杀及坠崖而死者无数，清军遂夺虎山墩，平凉全城尽在俯视之下。接着，图海下令炮击城中王辅臣军营，军民皆汹惧。六月初一，图海军据虎山墩断平凉饷道，并派参议道周昌进城招抚王辅臣。
周昌即周培公，荆门诸生，善用奇计。因辅佐振武将军吴丹有功，以七品官录用。图海军至潼关时，周昌求见，献招抚王辅臣之策，图海遂把他收为幕僚。王辅臣的总兵官黄九畴、布政使龚荣遇都是周昌的老乡，他们屡次劝说王辅臣投降，并以蜡丸密报周昌。周昌遂将此事报给图海，图海决定招降王辅臣。
王辅臣此时已穷蹙无计，只好派其副将谢天恩随周昌出城乞降。图海立即上奏康熙，康熙命颁布赦令，抚慰之。
初六日，图海复令周昌入城宣诏。次日，王辅臣派布政使龚荣遇等率士民至清军大营，献上军民册。又派其子王继桢及总兵蔡元等，上交吴三桂所颁给的敕书和印札。图海见王辅臣并未亲自出降，知其仍心怀疑惧，便于十三日又派周昌及前锋侍卫保定图海之侄再次入城，温言开导。至十五日，王辅臣最终下定决心，亲往图海营中，叩头谢恩，剃发归降。当然后来，王辅臣自知错的太多而选择了自杀。
到此，各路叛军要么投诚，要么被消灭，尤其是耿精忠和尚之信问题的解决，让形势朝有利于清廷的方向发展，就剩下吴三桂最后一股势力还负隅顽抗。
