相传上古时期，蚩尤部族与轩辕部族战于涿鹿，涿鹿之战战况持久，尸河遍野，民怨四起，天地间阴魂久久不散，天帝大怒，天帝伏曦遂命不死战神九天玄女前来调停。
玄女遂驭其坐驾不周山应龙前来平息战乱，然而玄女在调停过程中发现人世间充满自私、残暴、野蛮和阴暗，对蚩尤部族的残暴感到失望，遂将神剑赐于姬轩辕，传授姬轩辕兵法与房中之术。
奉礼太乙元君，受要记修道养生之法，于玄女受还精补脑之术。
玄女授帝如意神方，轩辕受要记修道养生之法。
于玄女所授房中之术，能御三百女。
玄女传授此二术后另让自己的坐骑九天应龙相助姬轩辕部族，最终姬轩辕终于险胜蚩尤部族。
玄女提前返回九天玄宫，涿鹿之战胜利之后，应龙却未遵玄女之意返回，而是于东海戏水，引发汹涌洪水吞没了整个东土大陆，人们流离失所，幸有大禹得玄女所托以定海神针稳住水患，洪水方为退却，天下回归太平。
诸事笃定之后，玄女坐骑九天应龙被天帝伏曦除去神职，贬于凡间东海一隅，日夜看守，隐住水患，实为戴罪之身。
而九天玄女，因违返天命，擅自单方面相助轩辕部族，部族之间失去制衡，导致后续众多小部族被吞并残杀，另有对自己的坐骑管教不力导致洪水泛滥，引来民怨，遂令玄女幽思禁闭。
会如此惩罚玄女主要是玄女乃是女娲一脉，不老不死不灭，同天帝一样是原始神，天界不死战神，所以只要玄女不愿意，天帝也惩罚不了玄女。
但玄女看到过人间的污浊、残暴、自私与阴暗，看到过人间疾苦，加上自己爱骑作乱引来灾劫，遂向天帝请愿，甘愿以每隔一个龙抬头的庚子纪年下凡人间，封琐神力以自己神圣仙躯降临人间，体验人世疾苦、人间百情，净化世间污秽。
